RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CS-230ENST00000551968 SIRT1Q96EB6 747 aa20.71■□□□□ 0.91
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CS-230ENST00000551968 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.7■□□□□ 0.9
CS-230ENST00000551968 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.69■□□□□ 0.9
CS-230ENST00000551968 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.69■□□□□ 0.9
CS-230ENST00000551968 PRAM1Q96QH2 718 aa20.68■□□□□ 0.9
CS-230ENST00000551968 ANKARQ7Z5J8 1434 aa20.67■□□□□ 0.9
CS-230ENST00000551968 PRR36Q9H6K5 1346 aa20.66■□□□□ 0.9
CS-230ENST00000551968 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
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CS-230ENST00000551968 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.65■□□□□ 0.9
CS-230ENST00000551968 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
CS-230ENST00000551968 SPON1Q9HCB6 807 aa20.65■□□□□ 0.9
CS-230ENST00000551968 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.65■□□□□ 0.9
CS-230ENST00000551968 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
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CS-230ENST00000551968 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.64■□□□□ 0.89
CS-230ENST00000551968 KCNQ2O43526 872 aa20.64■□□□□ 0.89
CS-230ENST00000551968 STRN4Q9NRL3 753 aa20.64■□□□□ 0.89
CS-230ENST00000551968 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
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CS-230ENST00000551968 NBPF14Q5TI25 921 aa20.62■□□□□ 0.89
CS-230ENST00000551968 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CS-230ENST00000551968 USP35Q9P2H5 1018 aa20.62■□□□□ 0.89
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CS-230ENST00000551968 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
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CS-230ENST00000551968 MYOM1P52179 1685 aa20.57■□□□□ 0.88
CS-230ENST00000551968 TULP4Q9NRJ4 1543 aa20.57■□□□□ 0.88
CS-230ENST00000551968 SSH2Q76I76 1423 aa20.56■□□□□ 0.88
CS-230ENST00000551968 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CS-230ENST00000551968 PDE3BQ13370 1112 aa20.56■□□□□ 0.88
CS-230ENST00000551968 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CS-230ENST00000551968 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CS-230ENST00000551968 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.55■□□□□ 0.88
CS-230ENST00000551968 BARGINQ6ZT62 677 aa20.55■□□□□ 0.88
CS-230ENST00000551968 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.54■□□□□ 0.88
CS-230ENST00000551968 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.54■□□□□ 0.88
CS-230ENST00000551968 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CS-230ENST00000551968 ADGRB1O14514 1584 aa20.54■□□□□ 0.88
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CS-230ENST00000551968 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CS-230ENST00000551968 LMO7Q8WWI1 1683 aa20.51■□□□□ 0.87
CS-230ENST00000551968 SBF2Q86WG5 1849 aa20.51■□□□□ 0.87
CS-230ENST00000551968 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.51■□□□□ 0.87
CS-230ENST00000551968 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CS-230ENST00000551968 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.5■□□□□ 0.87
CS-230ENST00000551968 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.5■□□□□ 0.87
CS-230ENST00000551968 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CS-230ENST00000551968 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.49■□□□□ 0.87
CS-230ENST00000551968 WASLO00401 505 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CS-230ENST00000551968 ZBTB7AO95365 584 aa20.49■□□□□ 0.87
CS-230ENST00000551968 PTGER2P43116 358 aa20.48■□□□□ 0.87
CS-230ENST00000551968 EVA1CP58658 441 aa20.48■□□□□ 0.87
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CS-230ENST00000551968 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.48■□□□□ 0.87
CS-230ENST00000551968 ATP7BP35670 1465 aa20.46■□□□□ 0.87
CS-230ENST00000551968 C1QTNF8P60827 252 aa20.46■□□□□ 0.87
CS-230ENST00000551968 ITSN1Q15811 1721 aa20.45■□□□□ 0.86
CS-230ENST00000551968 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CS-230ENST00000551968 CHD4Q14839 1912 aa20.45■□□□□ 0.86
CS-230ENST00000551968 PROM2Q8N271 834 aa20.44■□□□□ 0.86
CS-230ENST00000551968 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CS-230ENST00000551968 LRRC37A3O60309 1634 aa20.43■□□□□ 0.86
CS-230ENST00000551968 PLSCR1O15162 318 aa20.42■□□□□ 0.86
CS-230ENST00000551968 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CS-230ENST00000551968 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CS-230ENST00000551968 SYT17Q9BSW7 474 aa20.41■□□□□ 0.86
CS-230ENST00000551968 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.41■□□□□ 0.86
CS-230ENST00000551968 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa20.41■□□□□ 0.86
CS-230ENST00000551968 OVOS2Q6IE36 1432 aa20.41■□□□□ 0.86
CS-230ENST00000551968 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
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CS-230ENST00000551968 CPDO75976 1380 aa20.39■□□□□ 0.85
CS-230ENST00000551968 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CS-230ENST00000551968 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CS-230ENST00000551968 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CS-230ENST00000551968 CEP350Q5VT06 3117 aa20.36■□□□□ 0.85
CS-230ENST00000551968 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CS-230ENST00000551968 USP19O94966 1318 aa20.36■□□□□ 0.85
CS-230ENST00000551968 ACEP12821 1306 aa20.36■□□□□ 0.85
CS-230ENST00000551968 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.36■□□□□ 0.85
CS-230ENST00000551968 WNK3Q9BYP7 1800 aa20.35■□□□□ 0.85
CS-230ENST00000551968 CRB1P82279 1406 aa20.35■□□□□ 0.85
CS-230ENST00000551968 ABTB2Q8N961 1025 aa20.34■□□□□ 0.85
CS-230ENST00000551968 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CS-230ENST00000551968 GCP02774 474 aa20.31■□□□□ 0.84
CS-230ENST00000551968 SLC15A2Q16348 729 aa20.31■□□□□ 0.84
CS-230ENST00000551968 DDB1Q16531 1140 aa20.31■□□□□ 0.84
CS-230ENST00000551968 CDK19Q9BWU1 502 aa20.31■□□□□ 0.84
CS-230ENST00000551968 AKAP12Q02952 1782 aa20.31■□□□□ 0.84
CS-230ENST00000551968 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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