RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 PIK3C2GO75747 1445 aa28.71■■■□□ 2.19
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIM37O94972 964 aa28.69■■■□□ 2.18
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.69■■■□□ 2.18
CTDSP2-204ENST00000548823 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.68■■■□□ 2.18
CTDSP2-204ENST00000548823 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.68■■■□□ 2.18
CTDSP2-204ENST00000548823 APBA3O96018 575 aa28.66■■■□□ 2.18
CTDSP2-204ENST00000548823 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.66■■■□□ 2.18
CTDSP2-204ENST00000548823 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
CTDSP2-204ENST00000548823 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.65■■■□□ 2.18
CTDSP2-204ENST00000548823 ALS2Q96Q42 1657 aa28.64■■■□□ 2.17
CTDSP2-204ENST00000548823 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.63■■■□□ 2.17
CTDSP2-204ENST00000548823 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.62■■■□□ 2.17
CTDSP2-204ENST00000548823 NBPF14Q5TI25 921 aa28.62■■■□□ 2.17
CTDSP2-204ENST00000548823 RREB1Q92766 1687 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDSP2-204ENST00000548823 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDSP2-204ENST00000548823 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDSP2-204ENST00000548823 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
CTDSP2-204ENST00000548823 PRAM1Q96QH2 718 aa28.6■■■□□ 2.17
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
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CTDSP2-204ENST00000548823 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDSP2-204ENST00000548823 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDSP2-204ENST00000548823 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDSP2-204ENST00000548823 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDSP2-204ENST00000548823 KCNQ2O43526 872 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
CTDSP2-204ENST00000548823 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDSP2-204ENST00000548823 POGKQ9P215 609 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDSP2-204ENST00000548823 DLC1Q96QB1 1528 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDSP2-204ENST00000548823 PDE3BQ13370 1112 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDSP2-204ENST00000548823 STRN4Q9NRL3 753 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDSP2-204ENST00000548823 KIAA0232Q92628 1395 aa28.49■■■□□ 2.15
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CTDSP2-204ENST00000548823 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
CTDSP2-204ENST00000548823 CHRNA2Q15822 529 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDSP2-204ENST00000548823 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.45■■■□□ 2.15
CTDSP2-204ENST00000548823 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.45■■■□□ 2.14
CTDSP2-204ENST00000548823 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.45■■■□□ 2.14
CTDSP2-204ENST00000548823 USP35Q9P2H5 1018 aa28.45■■■□□ 2.14
CTDSP2-204ENST00000548823 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
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CTDSP2-204ENST00000548823 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa28.42■■■□□ 2.14
CTDSP2-204ENST00000548823 EVA1CP58658 441 aa28.4■■■□□ 2.14
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
CTDSP2-204ENST00000548823 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
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CTDSP2-204ENST00000548823 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
CTDSP2-204ENST00000548823 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.37■■■□□ 2.13
CTDSP2-204ENST00000548823 NEUROD1Q13562 356 aa28.36■■■□□ 2.13
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CTDSP2-204ENST00000548823 TONSLQ96HA7 1378 aa28.32■■■□□ 2.12
CTDSP2-204ENST00000548823 ADGRB1O14514 1584 aa28.32■■■□□ 2.12
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CTDSP2-204ENST00000548823 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.31■■■□□ 2.12
CTDSP2-204ENST00000548823 PLSCR1O15162 318 aa28.31■■■□□ 2.12
CTDSP2-204ENST00000548823 CASZ1Q86V15 1759 aa28.3■■■□□ 2.12
CTDSP2-204ENST00000548823 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.3■■■□□ 2.12
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CTDSP2-204ENST00000548823 ITSN1Q15811 1721 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDSP2-204ENST00000548823 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CTDSP2-204ENST00000548823 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.28■■■□□ 2.12
CTDSP2-204ENST00000548823 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.12
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CTDSP2-204ENST00000548823 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.25■■■□□ 2.11
CTDSP2-204ENST00000548823 C1QTNF8P60827 252 aa28.24■■■□□ 2.11
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CTDSP2-204ENST00000548823 CHD4Q14839 1912 aa28.23■■■□□ 2.11
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CTDSP2-204ENST00000548823 SBF2Q86WG5 1849 aa28.23■■■□□ 2.11
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CTDSP2-204ENST00000548823 ABTB2Q8N961 1025 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDSP2-204ENST00000548823 PROM2Q8N271 834 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDSP2-204ENST00000548823 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
CTDSP2-204ENST00000548823 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
CTDSP2-204ENST00000548823 USP19O94966 1318 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDSP2-204ENST00000548823 ACEP12821 1306 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDSP2-204ENST00000548823 CRB1P82279 1406 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDSP2-204ENST00000548823 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
CTDSP2-204ENST00000548823 DDB1Q16531 1140 aa28.13■■■□□ 2.09
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