RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543407.5

NPIPB5-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B5, human

TSL 5

Gene NPIPB5, Length 711 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB5-222	ENST00000543407	APBB1	O00213	710 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB5-222	ENST00000543407	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		10.32	□□□□□ -0.76
NPIPB5-222	ENST00000543407	USP17L8	P0C7I0	530 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NPIPB5-222	ENST00000543407	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NPIPB5-222	ENST00000543407	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
NPIPB5-222	ENST00000543407	RGS20	O76081	388 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NPIPB5-222	ENST00000543407	FLII	Q13045	1269 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NPIPB5-222	ENST00000543407	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
NPIPB5-222	ENST00000543407	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
NPIPB5-222	ENST00000543407	KCNH2	Q12809	1159 aa		10.28	□□□□□ -0.76
NPIPB5-222	ENST00000543407	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		10.28	□□□□□ -0.76
NPIPB5-222	ENST00000543407	RPIA	P49247	311 aa		10.27	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		10.27	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	CUX1	P39880	1505 aa		10.27	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	PNMA1	Q8ND90	353 aa		10.26	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	TOPBP1	Q92547	1522 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	CTH	P32929	405 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	TOP2B	Q02880	1626 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	PRDM2	Q13029	1718 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	SYNJ1	O43426	1573 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	MCM6	Q14566	821 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	SOGA1	O94964	1423 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	SLC19A1	P41440	591 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	SNRK	Q9NRH2	765 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	MAP10	Q9P2G4	905 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB5-222	ENST00000543407	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		10.21	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	TRIM32	Q13049	653 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	NBPF14	Q5TI25	921 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	WDR62	O43379	1518 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	WNT7B	P56706	349 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	NR6A1	Q15406	480 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	EEA1	Q15075	1411 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	KIF27	Q86VH2	1401 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	SPRYD7	Q5W111	196 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	IFT140	Q96RY7	1462 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NPIPB5-222	ENST00000543407	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB5-222	ENST00000543407	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB5-222	ENST00000543407	CUX2	O14529	1486 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB5-222	ENST00000543407	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NPIPB5-222	ENST00000543407	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB5-222	ENST00000543407	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB5-222	ENST00000543407	ZNF511	Q8NB15	262 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB5-222	ENST00000543407	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NPIPB5-222	ENST00000543407	RAD21	O60216	631 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NPIPB5-222	ENST00000543407	BAP1	Q92560	729 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NPIPB5-222	ENST00000543407	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NPIPB5-222	ENST00000543407	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
NPIPB5-222	ENST00000543407	SH3BP2	P78314	561 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB5-222	ENST00000543407	PTK2	Q05397	1052 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB5-222	ENST00000543407	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB5-222	ENST00000543407	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NPIPB5-222	ENST00000543407	WNT7A	O00755	349 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB5-222	ENST00000543407	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB5-222	ENST00000543407	WWC1	Q8IX03	1113 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB5-222	ENST00000543407	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB5-222	ENST00000543407	COG6	Q9Y2V7	657 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB5-222	ENST00000543407	IGF1R	P08069	1367 aa		10.09	□□□□□ -0.79
NPIPB5-222	ENST00000543407	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NPIPB5-222	ENST00000543407	ZNF592	Q92610	1267 aa		10.08	□□□□□ -0.8
NPIPB5-222	ENST00000543407	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
NPIPB5-222	ENST00000543407	SKOR1	P84550	965 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NPIPB5-222	ENST00000543407	LINC01559	Q495D7	138 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NPIPB5-222	ENST00000543407	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NPIPB5-222	ENST00000543407	ZBBX	A8MT70	800 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NPIPB5-222	ENST00000543407	GPR37L1	O60883	481 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NPIPB5-222	ENST00000543407	WASHC4	Q2M389	1173 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NPIPB5-222	ENST00000543407	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
NPIPB5-222	ENST00000543407	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NPIPB5-222	ENST00000543407	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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