RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRAM1Q96QH2 718 aa28.16■■■□□ 2.1
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADGRB2O60241 1585 aa28.13■■■□□ 2.09
CD27-AS1-208ENST00000538616 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.13■■■□□ 2.09
CD27-AS1-208ENST00000538616 POGKQ9P215 609 aa28.13■■■□□ 2.09
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRIM37O94972 964 aa28.11■■■□□ 2.09
CD27-AS1-208ENST00000538616 APBA3O96018 575 aa28.11■■■□□ 2.09
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.11■■■□□ 2.09
CD27-AS1-208ENST00000538616 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.1■■■□□ 2.09
CD27-AS1-208ENST00000538616 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
CD27-AS1-208ENST00000538616 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.09■■■□□ 2.09
CD27-AS1-208ENST00000538616 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.09■■■□□ 2.09
CD27-AS1-208ENST00000538616 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.08■■■□□ 2.09
CD27-AS1-208ENST00000538616 NBPF14Q5TI25 921 aa28.08■■■□□ 2.09
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.08■■■□□ 2.09
CD27-AS1-208ENST00000538616 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 ALS2Q96Q42 1657 aa28.05■■■□□ 2.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 DLC1Q96QB1 1528 aa28.04■■■□□ 2.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.03■■■□□ 2.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 PDE3BQ13370 1112 aa28.01■■■□□ 2.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPON1Q9HCB6 807 aa28.01■■■□□ 2.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 DCAF11Q8TEB1 546 aa28■■■□□ 2.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 STRN4Q9NRL3 753 aa27.99■■■□□ 2.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 BARGINQ6ZT62 677 aa27.98■■■□□ 2.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIAA0232Q92628 1395 aa27.98■■■□□ 2.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.96■■■□□ 2.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.95■■■□□ 2.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
CD27-AS1-208ENST00000538616 KCNQ2O43526 872 aa27.95■■■□□ 2.06
CD27-AS1-208ENST00000538616 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.95■■■□□ 2.06
CD27-AS1-208ENST00000538616 EVA1CP58658 441 aa27.94■■■□□ 2.06
CD27-AS1-208ENST00000538616 CHRNA2Q15822 529 aa27.94■■■□□ 2.06
CD27-AS1-208ENST00000538616 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
CD27-AS1-208ENST00000538616 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP35Q9P2H5 1018 aa27.93■■■□□ 2.06
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.93■■■□□ 2.06
CD27-AS1-208ENST00000538616 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa27.92■■■□□ 2.06
CD27-AS1-208ENST00000538616 RREB1Q92766 1687 aa27.92■■■□□ 2.06
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
CD27-AS1-208ENST00000538616 NUP188Q5SRE5 1749 aa27.88■■■□□ 2.05
CD27-AS1-208ENST00000538616 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.88■■■□□ 2.05
CD27-AS1-208ENST00000538616 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CD27-AS1-208ENST00000538616 SSH2Q76I76 1423 aa27.86■■■□□ 2.05
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATP7BP35670 1465 aa27.85■■■□□ 2.05
CD27-AS1-208ENST00000538616 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.85■■■□□ 2.05
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADGRB1O14514 1584 aa27.85■■■□□ 2.05
CD27-AS1-208ENST00000538616 STAC3Q96MF2 364 aa27.83■■■□□ 2.05
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CD27-AS1-208ENST00000538616 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CD27-AS1-208ENST00000538616 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLSCR1O15162 318 aa27.79■■■□□ 2.04
CD27-AS1-208ENST00000538616 NEUROD1Q13562 356 aa27.79■■■□□ 2.04
CD27-AS1-208ENST00000538616 NUTM2GQ5VZR2 741 aa27.78■■■□□ 2.04
CD27-AS1-208ENST00000538616 CPDO75976 1380 aa27.77■■■□□ 2.04
CD27-AS1-208ENST00000538616 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.76■■■□□ 2.03
CD27-AS1-208ENST00000538616 ITSN1Q15811 1721 aa27.75■■■□□ 2.03
CD27-AS1-208ENST00000538616 ABTB2Q8N961 1025 aa27.74■■■□□ 2.03
CD27-AS1-208ENST00000538616 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.74■■■□□ 2.03
CD27-AS1-208ENST00000538616 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
CD27-AS1-208ENST00000538616 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa27.73■■■□□ 2.03
CD27-AS1-208ENST00000538616 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa27.73■■■□□ 2.03
CD27-AS1-208ENST00000538616 OVOS2Q6IE36 1432 aa27.73■■■□□ 2.03
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC61Q9Y6R9 512 aa27.72■■■□□ 2.03
CD27-AS1-208ENST00000538616 ACEP12821 1306 aa27.71■■■□□ 2.03
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.7■■■□□ 2.03
CD27-AS1-208ENST00000538616 NLRP13Q86W25 1043 aa27.7■■■□□ 2.02
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP19O94966 1318 aa27.69■■■□□ 2.02
CD27-AS1-208ENST00000538616 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.69■■■□□ 2.02
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDK19Q9BWU1 502 aa27.69■■■□□ 2.02
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
CD27-AS1-208ENST00000538616 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
CD27-AS1-208ENST00000538616 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa27.68■■■□□ 2.02
CD27-AS1-208ENST00000538616 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLEKHG3A1L390 1219 aa27.68■■■□□ 2.02
CD27-AS1-208ENST00000538616 GCP02774 474 aa27.68■■■□□ 2.02
CD27-AS1-208ENST00000538616 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
CD27-AS1-208ENST00000538616 NRKQ7Z2Y5 1582 aa27.68■■■□□ 2.02
CD27-AS1-208ENST00000538616 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.68■■■□□ 2.02
CD27-AS1-208ENST00000538616 CRB1P82279 1406 aa27.67■■■□□ 2.02
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
CD27-AS1-208ENST00000538616 DDB1Q16531 1140 aa27.65■■■□□ 2.02
CD27-AS1-208ENST00000538616 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZBTB7AO95365 584 aa27.62■■■□□ 2.01
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTGER2P43116 358 aa27.62■■■□□ 2.01
CD27-AS1-208ENST00000538616 CASZ1Q86V15 1759 aa27.61■■■□□ 2.01
CD27-AS1-208ENST00000538616 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.61■■■□□ 2.01
CD27-AS1-208ENST00000538616 PEAK1Q9H792 1746 aa27.61■■■□□ 2.01
CD27-AS1-208ENST00000538616 SYT17Q9BSW7 474 aa27.59■■■□□ 2.01
CD27-AS1-208ENST00000538616 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CD27-AS1-208ENST00000538616 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CD27-AS1-208ENST00000538616 UTRNP46939 3433 aa27.58■■■□□ 2.01
CD27-AS1-208ENST00000538616 PROM2Q8N271 834 aa27.58■■■□□ 2.01
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
CD27-AS1-208ENST00000538616 STK32BQ9NY57 414 aa27.58■■■□□ 2.01
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