RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455811.2

LMCD1-AS1-206, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene LMCD1-AS1, Length 524 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.82■■□□□ 1.4
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 POGKQ9P215 609 aa23.82■■□□□ 1.4
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.79■■□□□ 1.4
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.79■■□□□ 1.4
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.78■■□□□ 1.4
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 ADGRB1O14514 1584 aa23.75■■□□□ 1.39
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.75■■□□□ 1.39
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 FAM182BQ5T319 152 aa23.73■■□□□ 1.39
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.73■■□□□ 1.39
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.71■■□□□ 1.39
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 ITSN1Q15811 1721 aa23.7■■□□□ 1.39
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.7■■□□□ 1.38
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.7■■□□□ 1.38
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 ATP7BP35670 1465 aa23.69■■□□□ 1.38
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 RREB1Q92766 1687 aa23.68■■□□□ 1.38
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.68■■□□□ 1.38
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 KIAA0232Q92628 1395 aa23.67■■□□□ 1.38
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 TRIM37O94972 964 aa23.67■■□□□ 1.38
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 APBA3O96018 575 aa23.64■■□□□ 1.37
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.63■■□□□ 1.37
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 BARGINQ6ZT62 677 aa23.62■■□□□ 1.37
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 STRN4Q9NRL3 753 aa23.62■■□□□ 1.37
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.61■■□□□ 1.37
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 NBPF14Q5TI25 921 aa23.61■■□□□ 1.37
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 SSH2Q76I76 1423 aa23.6■■□□□ 1.37
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 YY1P25490 414 aa23.6■■□□□ 1.37
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 PDE3BQ13370 1112 aa23.6■■□□□ 1.37
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CHRNA2Q15822 529 aa23.6■■□□□ 1.37
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 STAC3Q96MF2 364 aa23.59■■□□□ 1.37
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.57■■□□□ 1.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 EVA1CP58658 441 aa23.57■■□□□ 1.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 USP35Q9P2H5 1018 aa23.56■■□□□ 1.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.55■■□□□ 1.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.55■■□□□ 1.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.54■■□□□ 1.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CPDO75976 1380 aa23.54■■□□□ 1.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.54■■□□□ 1.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.54■■□□□ 1.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 SPON1Q9HCB6 807 aa23.54■■□□□ 1.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.52■■□□□ 1.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.52■■□□□ 1.36
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.51■■□□□ 1.35
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.5■■□□□ 1.35
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 KCNQ2O43526 872 aa23.49■■□□□ 1.35
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.49■■□□□ 1.35
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 USP19O94966 1318 aa23.49■■□□□ 1.35
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.48■■□□□ 1.35
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 ACEP12821 1306 aa23.48■■□□□ 1.35
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.47■■□□□ 1.35
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.47■■□□□ 1.35
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.47■■□□□ 1.35
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.46■■□□□ 1.35
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 ABTB2Q8N961 1025 aa23.46■■□□□ 1.35
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CDK19Q9BWU1 502 aa23.46■■□□□ 1.35
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.45■■□□□ 1.34
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CRB1P82279 1406 aa23.43■■□□□ 1.34
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 PEAK1Q9H792 1746 aa23.43■■□□□ 1.34
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 NLRP13Q86W25 1043 aa23.42■■□□□ 1.34
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 PLSCR1O15162 318 aa23.41■■□□□ 1.34
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 LRRC37A3O60309 1634 aa23.41■■□□□ 1.34
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 GCP02774 474 aa23.4■■□□□ 1.34
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.39■■□□□ 1.34
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CASZ1Q86V15 1759 aa23.39■■□□□ 1.33
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 SBF2Q86WG5 1849 aa23.37■■□□□ 1.33
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.36■■□□□ 1.33
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 DDB1Q16531 1140 aa23.35■■□□□ 1.33
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.35■■□□□ 1.33
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 BCL9O00512 1426 aa23.34■■□□□ 1.33
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 SLIT3O75094 1523 aa23.34■■□□□ 1.33
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.33■■□□□ 1.33
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 AKAP12Q02952 1782 aa23.29■■□□□ 1.32
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 MYOM1P52179 1685 aa23.29■■□□□ 1.32
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 USP6P35125 1406 aa23.29■■□□□ 1.32
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.29■■□□□ 1.32
LMCD1-AS1-206ENST00000455811 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.3 ms