RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.79■■□□□ 1.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRIM37O94972 964 aa24.79■■□□□ 1.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRAM1Q96QH2 718 aa24.78■■□□□ 1.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APBA3O96018 575 aa24.77■■□□□ 1.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.76■■□□□ 1.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NBPF14Q5TI25 921 aa24.76■■□□□ 1.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.76■■□□□ 1.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POGKQ9P215 609 aa24.75■■□□□ 1.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.74■■□□□ 1.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ALS2Q96Q42 1657 aa24.74■■□□□ 1.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.71■■□□□ 1.55
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPON1Q9HCB6 807 aa24.7■■□□□ 1.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DLC1Q96QB1 1528 aa24.7■■□□□ 1.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.68■■□□□ 1.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RREB1Q92766 1687 aa24.67■■□□□ 1.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDE3BQ13370 1112 aa24.67■■□□□ 1.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNQ2O43526 872 aa24.65■■□□□ 1.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BARGINQ6ZT62 677 aa24.65■■□□□ 1.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.65■■□□□ 1.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STRN4Q9NRL3 753 aa24.65■■□□□ 1.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIAA0232Q92628 1395 aa24.65■■□□□ 1.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.64■■□□□ 1.54
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.63■■□□□ 1.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.63■■□□□ 1.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.61■■□□□ 1.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHRNA2Q15822 529 aa24.61■■□□□ 1.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP35Q9P2H5 1018 aa24.61■■□□□ 1.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EVA1CP58658 441 aa24.6■■□□□ 1.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.57■■□□□ 1.52
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SSH2Q76I76 1423 aa24.56■■□□□ 1.52
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP7BP35670 1465 aa24.56■■□□□ 1.52
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.55■■□□□ 1.52
RFX3-AS1-201ENST00000423112 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADGRB1O14514 1584 aa24.53■■□□□ 1.52
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLSCR1O15162 318 aa24.48■■□□□ 1.51
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ITSN1Q15811 1721 aa24.47■■□□□ 1.51
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CPDO75976 1380 aa24.47■■□□□ 1.51
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.47■■□□□ 1.51
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.46■■□□□ 1.51
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.45■■□□□ 1.51
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.45■■□□□ 1.51
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.45■■□□□ 1.51
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.44■■□□□ 1.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.42■■□□□ 1.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.41■■□□□ 1.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABTB2Q8N961 1025 aa24.41■■□□□ 1.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.4■■□□□ 1.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP19O94966 1318 aa24.39■■□□□ 1.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ACEP12821 1306 aa24.39■■□□□ 1.5
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STAC3Q96MF2 364 aa24.39■■□□□ 1.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CASZ1Q86V15 1759 aa24.39■■□□□ 1.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CRB1P82279 1406 aa24.38■■□□□ 1.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.38■■□□□ 1.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZBTB7AO95365 584 aa24.37■■□□□ 1.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NLRP13Q86W25 1043 aa24.37■■□□□ 1.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GCP02774 474 aa24.36■■□□□ 1.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTGER2P43116 358 aa24.36■■□□□ 1.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDB1Q16531 1140 aa24.36■■□□□ 1.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDK19Q9BWU1 502 aa24.36■■□□□ 1.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PEAK1Q9H792 1746 aa24.35■■□□□ 1.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.35■■□□□ 1.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C1QTNF8P60827 252 aa24.35■■□□□ 1.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.34■■□□□ 1.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.33■■□□□ 1.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SYT17Q9BSW7 474 aa24.33■■□□□ 1.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYOM1P52179 1685 aa24.32■■□□□ 1.48
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STK32BQ9NY57 414 aa24.32■■□□□ 1.48
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PROM2Q8N271 834 aa24.31■■□□□ 1.48
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BCL9O00512 1426 aa24.3■■□□□ 1.48
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFFO2Q5TF58 517 aa24.3■■□□□ 1.48
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SBF2Q86WG5 1849 aa24.3■■□□□ 1.48
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.3■■□□□ 1.48
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRC37A3O60309 1634 aa24.28■■□□□ 1.48
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
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