RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367740.2

VAMP4-202, Transcript of vesicle associated membrane protein 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP4, Length 1,193 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4-202ENST00000367740 PIK3C2GO75747 1445 aa22.31■■□□□ 1.16
VAMP4-202ENST00000367740 APBA3O96018 575 aa22.3■■□□□ 1.16
VAMP4-202ENST00000367740 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.29■■□□□ 1.16
VAMP4-202ENST00000367740 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
VAMP4-202ENST00000367740 SPON1Q9HCB6 807 aa22.27■■□□□ 1.16
VAMP4-202ENST00000367740 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.26■■□□□ 1.15
VAMP4-202ENST00000367740 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.26■■□□□ 1.15
VAMP4-202ENST00000367740 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.26■■□□□ 1.15
VAMP4-202ENST00000367740 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.26■■□□□ 1.15
VAMP4-202ENST00000367740 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.26■■□□□ 1.15
VAMP4-202ENST00000367740 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.25■■□□□ 1.15
VAMP4-202ENST00000367740 SIRT1Q96EB6 747 aa22.25■■□□□ 1.15
VAMP4-202ENST00000367740 KCNQ2O43526 872 aa22.24■■□□□ 1.15
VAMP4-202ENST00000367740 CASZ1Q86V15 1759 aa22.24■■□□□ 1.15
VAMP4-202ENST00000367740 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
VAMP4-202ENST00000367740 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.23■■□□□ 1.15
VAMP4-202ENST00000367740 NBPF14Q5TI25 921 aa22.23■■□□□ 1.15
VAMP4-202ENST00000367740 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.23■■□□□ 1.15
VAMP4-202ENST00000367740 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
VAMP4-202ENST00000367740 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
VAMP4-202ENST00000367740 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.2■■□□□ 1.14
VAMP4-202ENST00000367740 IFFO2Q5TF58 517 aa22.2■■□□□ 1.14
VAMP4-202ENST00000367740 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
VAMP4-202ENST00000367740 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.2■■□□□ 1.14
VAMP4-202ENST00000367740 MYOM1P52179 1685 aa22.2■■□□□ 1.14
VAMP4-202ENST00000367740 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.19■■□□□ 1.14
VAMP4-202ENST00000367740 RGL3Q3MIN7 710 aa22.19■■□□□ 1.14
VAMP4-202ENST00000367740 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
VAMP4-202ENST00000367740 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.17■■□□□ 1.14
VAMP4-202ENST00000367740 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
VAMP4-202ENST00000367740 CHD4Q14839 1912 aa22.16■■□□□ 1.14
VAMP4-202ENST00000367740 KIAA0232Q92628 1395 aa22.16■■□□□ 1.14
VAMP4-202ENST00000367740 PRAM1Q96QH2 718 aa22.16■■□□□ 1.14
VAMP4-202ENST00000367740 DLC1Q96QB1 1528 aa22.16■■□□□ 1.14
VAMP4-202ENST00000367740 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
VAMP4-202ENST00000367740 STRN4Q9NRL3 753 aa22.14■■□□□ 1.13
VAMP4-202ENST00000367740 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.13■■□□□ 1.13
VAMP4-202ENST00000367740 CHRNA2Q15822 529 aa22.13■■□□□ 1.13
VAMP4-202ENST00000367740 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
VAMP4-202ENST00000367740 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.12■■□□□ 1.13
VAMP4-202ENST00000367740 PEAK1Q9H792 1746 aa22.12■■□□□ 1.13
VAMP4-202ENST00000367740 PDE3BQ13370 1112 aa22.12■■□□□ 1.13
VAMP4-202ENST00000367740 BARGINQ6ZT62 677 aa22.12■■□□□ 1.13
VAMP4-202ENST00000367740 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
VAMP4-202ENST00000367740 SBF2Q86WG5 1849 aa22.12■■□□□ 1.13
VAMP4-202ENST00000367740 SSH2Q76I76 1423 aa22.12■■□□□ 1.13
VAMP4-202ENST00000367740 CEP350Q5VT06 3117 aa22.12■■□□□ 1.13
VAMP4-202ENST00000367740 USP35Q9P2H5 1018 aa22.11■■□□□ 1.13
VAMP4-202ENST00000367740 C1QTNF8P60827 252 aa22.1■■□□□ 1.13
VAMP4-202ENST00000367740 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.1■■□□□ 1.13
VAMP4-202ENST00000367740 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
VAMP4-202ENST00000367740 ITSN1Q15811 1721 aa22.09■■□□□ 1.13
VAMP4-202ENST00000367740 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.08■■□□□ 1.13
VAMP4-202ENST00000367740 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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VAMP4-202ENST00000367740 ATP7BP35670 1465 aa22.05■■□□□ 1.12
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VAMP4-202ENST00000367740 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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VAMP4-202ENST00000367740 LRRC37A3O60309 1634 aa22.03■■□□□ 1.12
VAMP4-202ENST00000367740 PTGER2P43116 358 aa22.03■■□□□ 1.12
VAMP4-202ENST00000367740 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
VAMP4-202ENST00000367740 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.02■■□□□ 1.12
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VAMP4-202ENST00000367740 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.02■■□□□ 1.12
VAMP4-202ENST00000367740 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.02■■□□□ 1.12
VAMP4-202ENST00000367740 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.02■■□□□ 1.12
VAMP4-202ENST00000367740 ZBTB7AO95365 584 aa22.01■■□□□ 1.11
VAMP4-202ENST00000367740 EVA1CP58658 441 aa22■■□□□ 1.11
VAMP4-202ENST00000367740 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
VAMP4-202ENST00000367740 PLSCR1O15162 318 aa21.99■■□□□ 1.11
VAMP4-202ENST00000367740 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
VAMP4-202ENST00000367740 WNK3Q9BYP7 1800 aa21.98■■□□□ 1.11
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VAMP4-202ENST00000367740 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
VAMP4-202ENST00000367740 SYT17Q9BSW7 474 aa21.97■■□□□ 1.11
VAMP4-202ENST00000367740 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
VAMP4-202ENST00000367740 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.97■■□□□ 1.11
VAMP4-202ENST00000367740 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
VAMP4-202ENST00000367740 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.96■■□□□ 1.11
VAMP4-202ENST00000367740 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
VAMP4-202ENST00000367740 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
VAMP4-202ENST00000367740 CPDO75976 1380 aa21.95■■□□□ 1.1
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VAMP4-202ENST00000367740 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.94■■□□□ 1.1
VAMP4-202ENST00000367740 PROM2Q8N271 834 aa21.93■■□□□ 1.1
VAMP4-202ENST00000367740 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.93■■□□□ 1.1
VAMP4-202ENST00000367740 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
VAMP4-202ENST00000367740 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
VAMP4-202ENST00000367740 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.91■■□□□ 1.1
VAMP4-202ENST00000367740 CRB1P82279 1406 aa21.9■■□□□ 1.1
VAMP4-202ENST00000367740 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.9■■□□□ 1.1
VAMP4-202ENST00000367740 USP19O94966 1318 aa21.89■■□□□ 1.1
VAMP4-202ENST00000367740 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.89■■□□□ 1.09
VAMP4-202ENST00000367740 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
VAMP4-202ENST00000367740 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
VAMP4-202ENST00000367740 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
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