RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301021.7

TRAPPC2L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RIPK4P57078 832 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SNX21Q969T3 373 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SMC5Q8IY18 1101 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ERVK-7P63135 1459 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLEKHG5O94827 1062 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HS1BP3Q53T59 392 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPLO60437 1756 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IQGAP1P46940 1657 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CDCA8Q53HL2 280 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MYOM1P52179 1685 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WWC1Q8IX03 1113 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RLBP1P12271 317 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC2L-201ENST00000301021 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DYNC1I1O14576 645 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ADGRB1O14514 1584 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZFYVE9O95405 1425 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UQCRHP07919 91 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF445P59923 1031 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TNNQ9UQP3 1299 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MCM5P33992 734 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WDR63Q8IWG1 891 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SHPRHQ149N8 1683 aa22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC2L-201ENST00000301021 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCDC27Q2M243 656 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RUNDC1Q96C34 613 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TNRQ92752 1358 aa22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIF2CQ99661 725 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DMTNQ08495 405 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SSFA2P28290 1259 aa22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC2L-201ENST00000301021 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.1■■□□□ 1.13
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