RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000198296.1

Gm43017-201, mousemouse

BASIC

Gene Gm43017, Length 752 nt, Biotype sense intronic.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Zbtb4Q5F293 982 aa28.33■■■□□ 2.13
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa28.32■■■□□ 2.12
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Nfat5Q9WV30 1534 aa28.32■■■□□ 2.12
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa28.31■■■□□ 2.12
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Ltbp1Q8CG19 1712 aa28.3■■■□□ 2.12
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Col16a1Q8BLX7 1580 aa28.3■■■□□ 2.12
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Txnrd1Q9JMH6 613 aa28.3■■■□□ 2.12
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Shank2Q80Z38 1476 aa28.27■■■□□ 2.12
Gm43017-201ENSMUST00000198296 PaskQ8CEE6 1383 aa28.27■■■□□ 2.12
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Tet3Q8BG87 1668 aa28.27■■■□□ 2.12
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
Gm43017-201ENSMUST00000198296 CenpjQ569L8 1344 aa28.24■■■□□ 2.11
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Tnks1bp1P58871 1720 aa28.23■■■□□ 2.11
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Robo1O89026 1612 aa28.23■■■□□ 2.11
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Pola1P33609 1465 aa28.22■■■□□ 2.11
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Sbno1Q689Z5 1390 aa28.22■■■□□ 2.11
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Cacna1sQ02789 1880 aa28.21■■■□□ 2.11
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Bcl9lQ67FY2 1494 aa28.21■■■□□ 2.11
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Rtl5Q5DTT4 599 aa28.2■■■□□ 2.1
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Dzip1Q8BMD2 852 aa28.2■■■□□ 2.1
Gm43017-201ENSMUST00000198296 TimelessQ9R1X4 1197 aa28.19■■■□□ 2.1
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Zmym3Q9JLM4 1370 aa28.19■■■□□ 2.1
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Gsto1O09131 240 aa28.18■■■□□ 2.1
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Sugp2Q8CH09 1067 aa28.17■■■□□ 2.1
Gm43017-201ENSMUST00000198296 ZgpatQ8VDM1 511 aa28.17■■■□□ 2.1
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Srcin1Q9QWI6 1250 aa28.17■■■□□ 2.1
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa28.17■■■□□ 2.1
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Stard8Q8K031 1019 aa28.15■■■□□ 2.1
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Nid2O88322 1403 aa28.15■■■□□ 2.1
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Ccdc6D3YZP9 469 aa28.14■■■□□ 2.1
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa28.12■■■□□ 2.09
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Idi2Q8BFZ6 227 aa28.12■■■□□ 2.09
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Card11Q8CIS0 1159 aa28.12■■■□□ 2.09
Gm43017-201ENSMUST00000198296 HdgfP51859 237 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Ubap1lG3UW59 384 aa28.1■■■□□ 2.09
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Ccdc129Q14B48 1034 aa28.1■■■□□ 2.09
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Map3k19E9Q3S4 1311 aa28.1■■■□□ 2.09
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Fer1l6E0CZ42 1862 aa28.07■■■□□ 2.08
Gm43017-201ENSMUST00000198296 CatipB9EKE5 520 aa28.07■■■□□ 2.08
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Ly75Q60767 1723 aa28.06■■■□□ 2.08
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa28.06■■■□□ 2.08
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Mast2Q60592 1734 aa28.05■■■□□ 2.08
Gm43017-201ENSMUST00000198296 FanciQ8K368 1330 aa28.05■■■□□ 2.08
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa28.04■■■□□ 2.08
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Gm21698A0A087WQP8 267 aa28.04■■■□□ 2.08
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Gm21671G3UY31 267 aa28.04■■■□□ 2.08
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa28.03■■■□□ 2.08
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Rundc1Q0VDN7 615 aa28■■■□□ 2.07
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Pard3Q99NH2 1333 aa27.99■■■□□ 2.07
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Gimap6Q8K349 305 aa27.99■■■□□ 2.07
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Rock2P70336 1388 aa27.99■■■□□ 2.07
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Kat6bQ8BRB7 1872 aa27.96■■■□□ 2.07
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Cnga1P29974 684 aa27.96■■■□□ 2.07
Gm43017-201ENSMUST00000198296 InsrP15208 1372 aa27.94■■■□□ 2.06
Gm43017-201ENSMUST00000198296 TonslQ6NZL6 1363 aa27.94■■■□□ 2.06
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Kif16bB1AVY7 1312 aa27.91■■■□□ 2.06
Gm43017-201ENSMUST00000198296 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Ncoa4Q5U4H9 625 aa27.9■■■□□ 2.06
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Znf335A2A5K6 1337 aa27.9■■■□□ 2.06
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa27.89■■■□□ 2.06
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Taok3Q8BYC6 898 aa27.89■■■□□ 2.06
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Pm20d1Q8C165 503 aa27.87■■■□□ 2.05
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Slx1bQ8BX32 270 aa27.86■■■□□ 2.05
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Akap11E9Q777 1895 aa27.86■■■□□ 2.05
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Zeb2Q9R0G7 1215 aa27.85■■■□□ 2.05
Gm43017-201ENSMUST00000198296 OscarQ8VBT3 265 aa27.84■■■□□ 2.05
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa27.84■■■□□ 2.05
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Card10P58660 1021 aa27.83■■■□□ 2.05
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Dennd6aQ8BH65 605 aa27.83■■■□□ 2.05
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
Gm43017-201ENSMUST00000198296 TnrQ8BYI9 1358 aa27.81■■■□□ 2.04
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Amotl2Q8K371 772 aa27.8■■■□□ 2.04
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Nlgn1Q99K10 843 aa27.8■■■□□ 2.04
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Dnajc10Q9DC23 793 aa27.8■■■□□ 2.04
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Nwd2Q6P5U7 1742 aa27.8■■■□□ 2.04
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa27.77■■■□□ 2.04
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Kcnh5Q920E3 988 aa27.77■■■□□ 2.04
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Ubr1O70481 1757 aa27.76■■■□□ 2.03
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa27.74■■■□□ 2.03
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Mdc1Q5PSV9 1707 aa27.73■■■□□ 2.03
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Cabp4Q8VHC5 271 aa27.73■■■□□ 2.03
Gm43017-201ENSMUST00000198296 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa27.71■■■□□ 2.03
Gm43017-201ENSMUST00000198296 RgmbQ7TQ33 436 aa27.71■■■□□ 2.03
Gm43017-201ENSMUST00000198296 TatQ8QZR1 454 aa27.71■■■□□ 2.03
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Scn7aB1AYL1 1681 aa27.71■■■□□ 2.03
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Map2P20357 1828 aa27.7■■■□□ 2.02
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Fmnl2A2APV2 1086 aa27.7■■■□□ 2.02
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Astn2Q80Z10 1352 aa27.7■■■□□ 2.02
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
Gm43017-201ENSMUST00000198296 GakQ99KY4 1305 aa27.67■■■□□ 2.02
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa27.66■■■□□ 2.02
Gm43017-201ENSMUST00000198296 FancaQ9JL70 1439 aa27.66■■■□□ 2.02
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa27.65■■■□□ 2.02
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa27.64■■■□□ 2.01
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Apba2P98084 750 aa27.63■■■□□ 2.01
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Pak3Q61036 559 aa27.63■■■□□ 2.01
Gm43017-201ENSMUST00000198296 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
Gm43017-201ENSMUST00000198296 FocadA2AKG8 1798 aa27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 121.1 ms