RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000152170.7

Pdss1-207, Transcript of Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdss1, Length 1,538 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
Pdss1-207ENSMUST00000152170 CatipB9EKE5 520 aa30.18■■■□□ 2.42
Pdss1-207ENSMUST00000152170 InsrP15208 1372 aa30.18■■■□□ 2.42
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa30.17■■■□□ 2.42
Pdss1-207ENSMUST00000152170 NinlQ6ZQ12 1394 aa30.16■■■□□ 2.42
Pdss1-207ENSMUST00000152170 TimelessQ9R1X4 1197 aa30.16■■■□□ 2.42
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Sbno1Q689Z5 1390 aa30.13■■■□□ 2.41
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Col16a1Q8BLX7 1580 aa30.12■■■□□ 2.41
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cypt1Q8CH20 168 aa30.12■■■□□ 2.41
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Eno4Q8C042 619 aa30.11■■■□□ 2.41
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa30.1■■■□□ 2.41
Pdss1-207ENSMUST00000152170 InhbeO08717 350 aa30.09■■■□□ 2.41
Pdss1-207ENSMUST00000152170 PaskQ8CEE6 1383 aa30.08■■■□□ 2.41
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Zmym3Q9JLM4 1370 aa30.08■■■□□ 2.41
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cnga1P29974 684 aa30.06■■■□□ 2.4
Pdss1-207ENSMUST00000152170 ZgpatQ8VDM1 511 aa30.06■■■□□ 2.4
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Znf335A2A5K6 1337 aa30.06■■■□□ 2.4
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa30.06■■■□□ 2.4
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Dzip1Q8BMD2 852 aa30.06■■■□□ 2.4
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Txnrd1Q9JMH6 613 aa30.04■■■□□ 2.4
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Bcl9lQ67FY2 1494 aa30.03■■■□□ 2.4
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Psrc1Q9D0P7 329 aa30.01■■■□□ 2.4
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gimap6Q8K349 305 aa30.01■■■□□ 2.39
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Nfat5Q9WV30 1534 aa30■■■□□ 2.39
Pdss1-207ENSMUST00000152170 HdgfP51859 237 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Tet3Q8BG87 1668 aa29.97■■■□□ 2.39
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rtl5Q5DTT4 599 aa29.96■■■□□ 2.39
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ncoa4Q5U4H9 625 aa29.96■■■□□ 2.39
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Nid2O88322 1403 aa29.95■■■□□ 2.39
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Kif16bB1AVY7 1312 aa29.94■■■□□ 2.38
Pdss1-207ENSMUST00000152170 MpndQ3TV65 487 aa29.93■■■□□ 2.38
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Shank2Q80Z38 1476 aa29.91■■■□□ 2.38
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gm21698A0A087WQP8 267 aa29.88■■■□□ 2.37
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gm21671G3UY31 267 aa29.88■■■□□ 2.37
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa29.88■■■□□ 2.37
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa29.88■■■□□ 2.37
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa29.85■■■□□ 2.37
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Dennd6aQ8BH65 605 aa29.84■■■□□ 2.37
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rgs17Q9QZB0 210 aa29.83■■■□□ 2.37
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Pard3Q99NH2 1333 aa29.82■■■□□ 2.36
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Nlgn1Q99K10 843 aa29.82■■■□□ 2.36
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ccdc129Q14B48 1034 aa29.8■■■□□ 2.36
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Astn2Q80Z10 1352 aa29.79■■■□□ 2.36
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Slx1bQ8BX32 270 aa29.78■■■□□ 2.36
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa29.78■■■□□ 2.36
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Card10P58660 1021 aa29.77■■■□□ 2.36
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Kcnh5Q920E3 988 aa29.77■■■□□ 2.36
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ltbp1Q8CG19 1712 aa29.76■■■□□ 2.35
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Slc4a1apE9PX68 744 aa29.76■■■□□ 2.35
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Slc24a1Q91WD8 1130 aa29.75■■■□□ 2.35
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cabp4Q8VHC5 271 aa29.72■■■□□ 2.35
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Dnajc10Q9DC23 793 aa29.72■■■□□ 2.35
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Amotl2Q8K371 772 aa29.71■■■□□ 2.35
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cacna1sQ02789 1880 aa29.71■■■□□ 2.35
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Col22a1E9Q7P1 1613 aa29.71■■■□□ 2.35
Pdss1-207ENSMUST00000152170 TnrQ8BYI9 1358 aa29.71■■■□□ 2.35
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa29.69■■■□□ 2.34
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Zeb2Q9R0G7 1215 aa29.69■■■□□ 2.34
Pdss1-207ENSMUST00000152170 CemipQ8BI06 1361 aa29.68■■■□□ 2.34
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Fmnl2A2APV2 1086 aa29.67■■■□□ 2.34
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ano8Q6PB70 1060 aa29.66■■■□□ 2.34
Pdss1-207ENSMUST00000152170 TatQ8QZR1 454 aa29.66■■■□□ 2.34
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Pm20d1Q8C165 503 aa29.66■■■□□ 2.34
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Fer1l6E0CZ42 1862 aa29.65■■■□□ 2.34
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ubr1O70481 1757 aa29.64■■■□□ 2.33
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Fam184bQ0KK56 942 aa29.63■■■□□ 2.33
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Mdc1Q5PSV9 1707 aa29.63■■■□□ 2.33
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Sugp2Q8CH09 1067 aa29.59■■■□□ 2.33
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Tnks1bp1P58871 1720 aa29.59■■■□□ 2.33
Pdss1-207ENSMUST00000152170 RgmbQ7TQ33 436 aa29.58■■■□□ 2.33
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
Pdss1-207ENSMUST00000152170 FancaQ9JL70 1439 aa29.58■■■□□ 2.33
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ccdc6D3YZP9 469 aa29.55■■■□□ 2.32
Pdss1-207ENSMUST00000152170 PrxO55103 1391 aa29.55■■■□□ 2.32
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Scn7aB1AYL1 1681 aa29.55■■■□□ 2.32
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Robo1O89026 1612 aa29.55■■■□□ 2.32
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Map2P20357 1828 aa29.54■■■□□ 2.32
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Tmf1B9EKI3 1091 aa29.54■■■□□ 2.32
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa29.54■■■□□ 2.32
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Pank3Q8R2W9 370 aa29.54■■■□□ 2.32
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Mast2Q60592 1734 aa29.53■■■□□ 2.32
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Tmem132eQ6IEE6 982 aa29.52■■■□□ 2.32
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Kat6bQ8BRB7 1872 aa29.52■■■□□ 2.32
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Taok3Q8BYC6 898 aa29.5■■■□□ 2.31
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Birc3O08863 600 aa29.48■■■□□ 2.31
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ly75Q60767 1723 aa29.48■■■□□ 2.31
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Akap11E9Q777 1895 aa29.47■■■□□ 2.31
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Inpp5dQ9ES52 1191 aa29.47■■■□□ 2.31
Pdss1-207ENSMUST00000152170 CrklP47941 303 aa29.46■■■□□ 2.31
Pdss1-207ENSMUST00000152170 OptnQ8K3K8 584 aa29.46■■■□□ 2.31
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Wdr66E9Q743 1299 aa29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 110.1 ms