RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000152170.7

Pdss1-207, Transcript of Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdss1, Length 1,538 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa49,05■■■■■ 5,44
Pdss1-207ENSMUST00000152170 NischQ80TM9 1593 aa48,39■■■■■ 5,34
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Abcc8B2RUS7 1588 aa46,84■■■■■ 5,09
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Abcc9P70170 1546 aa46,81■■■■■ 5,08
Pdss1-207ENSMUST00000152170 ScribQ80U72 1612 aa45,2■■■■■ 4,83
Pdss1-207ENSMUST00000152170 NacadQ5SWP3 1504 aa43,78■■■■■ 4,6
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Kdm5dQ62240 1548 aa43,69■■■■■ 4,58
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Dcaf1Q80TR8 1506 aa43,04■■■■■ 4,48
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Sycp2Q9CUU3 1500 aa42,93■■■■■ 4,46
Pdss1-207ENSMUST00000152170 BicraF8VPZ9 1578 aa42,36■■■■■ 4,37
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa42,15■■■■■ 4,34
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rhox8Q6VSS7 320 aa41,74■■■■■ 4,27
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Baz1aO88379 1555 aa41,56■■■■■ 4,24
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ccdc180J3QNE4 1664 aa41,49■■■■■ 4,23
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Crybg2B7ZCC2 1516 aa41,44■■■■■ 4,23
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa41,4■■■■■ 4,22
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP41,2■■■■■ 4,19
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP40,98■■■■■ 4,15
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP40,86■■■■■ 4,13
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP40,79■■■■■ 4,12
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP40,39■■■■■ 4,06
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Smarca2Q6DIC0 1577 aa40,33■■■■■ 4,05
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa40,3■■■■■ 4,04
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ercc6F8VPZ5 1481 aa40,29■■■■■ 4,04
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa40,21■■■■■ 4,03
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa40,19■■■■■ 4,02
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Fam135aQ6NS59 1506 aa39,92■■■■□ 3,98
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Wdr62Q3U3T8 1523 aa39,86■■■■□ 3,97
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Frmpd1A2AKB4 1549 aa39,84■■■■□ 3,97
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP39,65■■■■□ 3,94
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rtl1Q7M732 1744 aa39,52■■■■□ 3,92
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Baz1bQ9Z277 1479 aa39,45■■■■□ 3,91
Pdss1-207ENSMUST00000152170 CftrP26361 1476 aa39,36■■■■□ 3,89
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ubl4bQ9CQ84 188 aa39,31■■■■□ 3,88
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa39,26■■■■□ 3,88
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Synj1Q8CHC4 1574 aa39,24■■■■□ 3,87
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Unc13aQ4KUS2 1712 aa39,23■■■■□ 3,87
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP39,21■■■■□ 3,87
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa39,11■■■■□ 3,85
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Mrc2Q64449 1479 aa39■■■■□ 3,83
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP38,65■■■■□ 3,78
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Trim41Q5NCC3 630 aa38,5■■■■□ 3,75
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP38,44■■■■□ 3,74
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cux2P70298 1426 aa38,39■■■■□ 3,74
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Kif15Q6P9L6 1387 aa38,38■■■■□ 3,74
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Lamc3Q9R0B6 1581 aa38,21■■■■□ 3,71
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa38,13■■■■□ 3,7
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Kif21aQ9QXL2 1672 aa38,06■■■■□ 3,68
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP37,99■■■■□ 3,67
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cep164Q5DU05 1446 aa37,83■■■■□ 3,65
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Golga3P55937 1487 aa37,8■■■■□ 3,64
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Top2bQ64511 1612 aa37,75■■■■□ 3,63
Pdss1-207ENSMUST00000152170 TnnQ80Z71 1560 aa37,74■■■■□ 3,63
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cngb1E1AZ71 1325 aa37,65■■■■□ 3,62
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ccdc18Q640L5 1455 aa37,65■■■■□ 3,62
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Il27Q8K3I6 234 aa37,6■■■■□ 3,61
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP37,58■■■■□ 3,61
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP37,58■■■■□ 3,61
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Dnajc5P60904 198 aa37,54■■■■□ 3,6
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP37,52■■■■□ 3,6
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Camsap1A2AHC3 1581 aa37,5■■■■□ 3,59
Pdss1-207ENSMUST00000152170 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP37,5■■■■□ 3,59
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Plb1Q3TTY0 1478 aa37,46■■■■□ 3,59
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Fmn1Q05860 1466 aa37,39■■■■□ 3,58
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Crocc2F6XLV1 1638 aa37,35■■■■□ 3,57
Pdss1-207ENSMUST00000152170 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP37,26■■■■□ 3,56
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Shroom2A2ALU4 1481 aa37,2■■■■□ 3,55
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ift140E9PY46 1464 aa37,11■■■■□ 3,53
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Duox2A2AQ99 1517 aa37,08■■■■□ 3,53
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Grin2bQ01097 1482 aa37■■■■□ 3,51
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rusc2Q80U22 1514 aa36,98■■■■□ 3,51
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Disp1Q3TDN0 1521 aa36,87■■■■□ 3,49
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP36,85■■■■□ 3,49
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Efcab5A0JP43 1406 aa36,79■■■■□ 3,48
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa36,78■■■■□ 3,48
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Samd9lQ69Z37 1561 aa36,76■■■■□ 3,47
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Col17a1Q07563 1470 aa36,71■■■■□ 3,47
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP36,69■■■■□ 3,46
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa36,64■■■■□ 3,46
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP36,64■■■■□ 3,46
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP36,63■■■■□ 3,46
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Setd1bQ8CFT2 1985 aa36,63■■■■□ 3,45
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP36,6■■■■□ 3,45
Pdss1-207ENSMUST00000152170 NrkQ9R0G8 1455 aa36,58■■■■□ 3,45
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rad54l2Q99NG0 1466 aa36,55■■■■□ 3,44
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Chic1Q8CBW7 227 aa36,53■■■■□ 3,44
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Grin2aP35436 1464 aa36,45■■■■□ 3,43
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Magi3Q9EQJ9 1476 aa36,45■■■■□ 3,42
Pdss1-207ENSMUST00000152170 PtprkP35822 1457 aa36,4■■■■□ 3,42
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Shroom4Q1W617 1475 aa36,39■■■■□ 3,42
Pdss1-207ENSMUST00000152170 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP36,37■■■■□ 3,41
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP36,32■■■■□ 3,4
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Fgd6Q69ZL1 1399 aa36,27■■■■□ 3,4
Pdss1-207ENSMUST00000152170 SynmQ70IV5 1561 aa36,22■■■■□ 3,39
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Pla2r1Q62028 1487 aa36,22■■■■□ 3,39
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gpatch8A2A6A1 1505 aa36,17■■■■□ 3,38
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Zeb1Q64318 1117 aa36,08■■■■□ 3,37
Pdss1-207ENSMUST00000152170 AknaQ80VW7 1404 aa35,99■■■■□ 3,35
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Adgrl3Q80TS3 1537 aa35,98■■■■□ 3,35
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa35,98■■■■□ 3,35
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