RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111980.3

Hoxd4-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd4, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
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Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Emilin2Q8K482 1074 aa27.57■■■□□ 2
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Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dzip1Q8BMD2 852 aa27.5■■□□□ 1.99
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa27.49■■□□□ 1.99
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kif16bB1AVY7 1312 aa27.47■■□□□ 1.99
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
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Hoxd4-202ENSMUST00000111980 NinlQ6ZQ12 1394 aa27.44■■□□□ 1.98
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Eno4Q8C042 619 aa27.43■■□□□ 1.98
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gimap6Q8K349 305 aa27.43■■□□□ 1.98
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nid2O88322 1403 aa27.43■■□□□ 1.98
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 ZgpatQ8VDM1 511 aa27.42■■□□□ 1.98
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc24a1Q91WD8 1130 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc4a1apE9PX68 744 aa27.38■■□□□ 1.97
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ncoa4Q5U4H9 625 aa27.38■■□□□ 1.97
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa27.36■■□□□ 1.97
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 InhbeO08717 350 aa27.36■■□□□ 1.97
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Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rtl5Q5DTT4 599 aa27.33■■□□□ 1.97
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Astn2Q80Z10 1352 aa27.33■■□□□ 1.97
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dennd6aQ8BH65 605 aa27.33■■□□□ 1.97
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Shank2Q80Z38 1476 aa27.33■■□□□ 1.96
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm21698A0A087WQP8 267 aa27.32■■□□□ 1.96
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm21671G3UY31 267 aa27.32■■□□□ 1.96
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nlgn1Q99K10 843 aa27.32■■□□□ 1.96
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa27.3■■□□□ 1.96
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa27.29■■□□□ 1.96
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mdc1Q5PSV9 1707 aa27.27■■□□□ 1.96
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam184bQ0KK56 942 aa27.26■■□□□ 1.95
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pard3Q99NH2 1333 aa27.25■■□□□ 1.95
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ubr1O70481 1757 aa27.25■■□□□ 1.95
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PrxO55103 1391 aa27.24■■□□□ 1.95
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa27.24■■□□□ 1.95
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kcnh5Q920E3 988 aa27.23■■□□□ 1.95
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 CemipQ8BI06 1361 aa27.23■■□□□ 1.95
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 TnrQ8BYI9 1358 aa27.23■■□□□ 1.95
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cabp4Q8VHC5 271 aa27.22■■□□□ 1.95
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Scn7aB1AYL1 1681 aa27.21■■□□□ 1.95
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dnajc10Q9DC23 793 aa27.21■■□□□ 1.95
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Card10P58660 1021 aa27.2■■□□□ 1.95
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ltbp1Q8CG19 1712 aa27.2■■□□□ 1.94
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 MpndQ3TV65 487 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pank3Q8R2W9 370 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmf1B9EKI3 1091 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccdc129Q14B48 1034 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slx1bQ8BX32 270 aa27.19■■□□□ 1.94
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 FancaQ9JL70 1439 aa27.18■■□□□ 1.94
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Robo1O89026 1612 aa27.18■■□□□ 1.94
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cacna1sQ02789 1880 aa27.16■■□□□ 1.94
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Amotl2Q8K371 772 aa27.16■■□□□ 1.94
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 TatQ8QZR1 454 aa27.16■■□□□ 1.94
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Map2P20357 1828 aa27.15■■□□□ 1.94
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fmnl2A2APV2 1086 aa27.15■■□□□ 1.94
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ano8Q6PB70 1060 aa27.14■■□□□ 1.94
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Inpp5dQ9ES52 1191 aa27.14■■□□□ 1.94
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fer1l6E0CZ42 1862 aa27.1■■□□□ 1.93
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Plekhg5Q66T02 1073 aa27.08■■□□□ 1.93
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rgs17Q9QZB0 210 aa27.08■■□□□ 1.93
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zeb2Q9R0G7 1215 aa27.08■■□□□ 1.93
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Birc3O08863 600 aa27.07■■□□□ 1.92
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dcaf11Q91VU6 549 aa27.07■■□□□ 1.92
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 ClspnQ80YR7 1315 aa27.06■■□□□ 1.92
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Col22a1E9Q7P1 1613 aa27.05■■□□□ 1.92
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmem132eQ6IEE6 982 aa27.05■■□□□ 1.92
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 RgmbQ7TQ33 436 aa27.05■■□□□ 1.92
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zscan10Q3URR7 782 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pm20d1Q8C165 503 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mast2Q60592 1734 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hoxb7P09024 217 aa27■■□□□ 1.91
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tnks1bp1P58871 1720 aa26.99■■□□□ 1.91
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa26.99■■□□□ 1.91
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cypt1Q8CH20 168 aa26.99■■□□□ 1.91
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kat6bQ8BRB7 1872 aa26.98■■□□□ 1.91
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hoxc9P09633 260 aa26.98■■□□□ 1.91
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 CrklP47941 303 aa26.97■■□□□ 1.91
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