RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047993.9

Hoxa13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Hoxa13, Length 1,309 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
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Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gimap6Q8K349 305 aa35.58■■■■□ 3.29
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cacna1sQ02789 1880 aa35.58■■■■□ 3.29
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Znf335A2A5K6 1337 aa35.57■■■■□ 3.28
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Kif16bB1AVY7 1312 aa35.57■■■■□ 3.28
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa35.56■■■■□ 3.28
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Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm21671G3UY31 267 aa35.55■■■■□ 3.28
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa35.49■■■■□ 3.27
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ncoa4Q5U4H9 625 aa35.48■■■■□ 3.27
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa35.47■■■■□ 3.27
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Hoxa13-201ENSMUST00000047993 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
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Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa35.4■■■■□ 3.26
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Nlgn1Q99K10 843 aa35.38■■■■□ 3.25
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Pard3Q99NH2 1333 aa35.38■■■■□ 3.25
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Fer1l6E0CZ42 1862 aa35.34■■■■□ 3.25
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Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Astn2Q80Z10 1352 aa35.32■■■■□ 3.24
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Slc4a1apE9PX68 744 aa35.32■■■■□ 3.24
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Kcnh5Q920E3 988 aa35.32■■■■□ 3.24
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Mast2Q60592 1734 aa35.31■■■■□ 3.24
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Card10P58660 1021 aa35.31■■■■□ 3.24
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Dnajc10Q9DC23 793 aa35.31■■■■□ 3.24
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Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Slx1bQ8BX32 270 aa35.28■■■■□ 3.24
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
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Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Fmnl2A2APV2 1086 aa35.24■■■■□ 3.23
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Zeb2Q9R0G7 1215 aa35.24■■■■□ 3.23
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Taok3Q8BYC6 898 aa35.23■■■■□ 3.23
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Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Mdc1Q5PSV9 1707 aa35.18■■■■□ 3.22
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Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Tmem132eQ6IEE6 982 aa35.09■■■■□ 3.21
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Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Pank3Q8R2W9 370 aa35.03■■■■□ 3.2
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