RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000030117.4

Smu1-201, Transcript of WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Smu1, Length 2,418 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1-201ENSMUST00000030117 Hs1bp3Q3TC93 395 aa22.61■■□□□ 1.21
Smu1-201ENSMUST00000030117 CatipB9EKE5 520 aa22.6■■□□□ 1.21
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nrxn1Q9CS84 1514 aa22.6■■□□□ 1.21
Smu1-201ENSMUST00000030117 OvosQ3UU35 1456 aa22.6■■□□□ 1.21
Smu1-201ENSMUST00000030117 Map7O88735 730 aa22.59■■□□□ 1.21
Smu1-201ENSMUST00000030117 Akap12Q9WTQ5 1684 aa22.59■■□□□ 1.21
Smu1-201ENSMUST00000030117 Catsper2A2ARP9 588 aa22.58■■□□□ 1.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kif2cQ922S8 721 aa22.58■■□□□ 1.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 Zranb1Q7M760 708 aa22.57■■□□□ 1.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 Znf330Q922H9 316 aa22.57■■□□□ 1.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ccdc60Q8C4J0 545 aa22.56■■□□□ 1.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 Stk26Q99JT2 416 aa22.56■■□□□ 1.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 PtprtQ99M80 1454 aa22.55■■□□□ 1.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 AU015836B2RUM3 263 aa22.55■■□□□ 1.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa22.55■■□□□ 1.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kif18aQ91WD7 886 aa22.55■■□□□ 1.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa22.55■■□□□ 1.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cavin4A2AMM0 362 aa22.54■■□□□ 1.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 Terf2O35144 541 aa22.54■■□□□ 1.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ciz1Q8VEH2 845 aa22.54■■□□□ 1.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kcnn1Q9EQR3 537 aa22.54■■□□□ 1.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ankrd50F7BE84 1390 aa22.54■■□□□ 1.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa22.54■■□□□ 1.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mroh1E0CZ22 1640 aa22.52■■□□□ 1.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pdcl3Q8BVF2 240 aa22.52■■□□□ 1.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ptch1Q61115 1434 aa22.51■■□□□ 1.19
Smu1-201ENSMUST00000030117 SkilQ60665 675 aa22.51■■□□□ 1.19
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cog6Q8R3I3 657 aa22.5■■□□□ 1.19
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa22.5■■□□□ 1.19
Smu1-201ENSMUST00000030117 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
Smu1-201ENSMUST00000030117 Atp10aO54827 1508 aa22.5■■□□□ 1.19
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mcm4P49717 862 aa22.49■■□□□ 1.19
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ssh1Q76I79 1042 aa22.49■■□□□ 1.19
Smu1-201ENSMUST00000030117 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa22.49■■□□□ 1.19
Smu1-201ENSMUST00000030117 PaskQ8CEE6 1383 aa22.48■■□□□ 1.19
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nutm1Q8BHP2 1126 aa22.47■■□□□ 1.19
Smu1-201ENSMUST00000030117 FanciQ8K368 1330 aa22.47■■□□□ 1.19
Smu1-201ENSMUST00000030117 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
Smu1-201ENSMUST00000030117 Phf14Q9D4H9 881 aa22.47■■□□□ 1.19
Smu1-201ENSMUST00000030117 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
Smu1-201ENSMUST00000030117 Atp1b4Q99ME6 356 aa22.46■■□□□ 1.19
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pik3r4Q8VD65 1358 aa22.44■■□□□ 1.18
Smu1-201ENSMUST00000030117 Znf541Q0GGX2 1363 aa22.44■■□□□ 1.18
Smu1-201ENSMUST00000030117 Knl1Q66JQ7 1612 aa22.43■■□□□ 1.18
Smu1-201ENSMUST00000030117 Swt1Q9DBQ9 907 aa22.42■■□□□ 1.18
Smu1-201ENSMUST00000030117 NinlQ6ZQ12 1394 aa22.42■■□□□ 1.18
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cfap65Q3V0B4 1847 aa22.42■■□□□ 1.18
Smu1-201ENSMUST00000030117 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa22.42■■□□□ 1.18
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gsto1O09131 240 aa22.41■■□□□ 1.18
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nectin2P32507 530 aa22.41■■□□□ 1.18
Smu1-201ENSMUST00000030117 Shq1Q7TMX5 569 aa22.41■■□□□ 1.18
Smu1-201ENSMUST00000030117 Slc12a5Q91V14 1138 aa22.41■■□□□ 1.18
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tmco5bQ80X59 307 aa22.41■■□□□ 1.18
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
Smu1-201ENSMUST00000030117 Plcb2A3KGF7 1181 aa22.4■■□□□ 1.18
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kif20aP97329 887 aa22.4■■□□□ 1.18
Smu1-201ENSMUST00000030117 Aplp1Q03157 653 aa22.4■■□□□ 1.18
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gtf2a1Q99PM3 378 aa22.4■■□□□ 1.18
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gm10093D3YYI8 482 aa22.4■■□□□ 1.18
Smu1-201ENSMUST00000030117 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
Smu1-201ENSMUST00000030117 Q4VA45 678 aa22.4■■□□□ 1.18
Smu1-201ENSMUST00000030117 PalmQ9Z0P4 383 aa22.4■■□□□ 1.18
Smu1-201ENSMUST00000030117 Naip7Q9JIB3 1402 aa22.39■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 Fchsd2Q3USJ8 740 aa22.39■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rfx1P48377 963 aa22.38■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cep170bQ80U49 1574 aa22.38■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 AglF8VPN4 1532 aa22.38■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa22.38■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 Il4rP16382 810 aa22.37■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ecm2Q5FW85 670 aa22.37■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa22.37■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nsd3Q6P2L6 1439 aa22.37■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ddit3P35639 168 aa22.37■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 Q3UPC7 1272 aa22.37■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 Wwc1Q5SXA9 1104 aa22.37■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 Atp7bQ64446 1462 aa22.37■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 MvpQ9EQK5 861 aa22.36■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cdk19Q8BWD8 501 aa22.36■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 Usp32F8VPZ3 1604 aa22.35■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa22.35■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 AdgbG3UZ78 1657 aa22.35■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 Dip2cE9PWR4 1557 aa22.35■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rsph3aQ3UFY4 516 aa22.35■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 Wdr63B2RY71 923 aa22.34■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cetn4Q8K4K1 168 aa22.34■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa22.33■■□□□ 1.17
Smu1-201ENSMUST00000030117 Vamp4O70480 141 aa22.32■■□□□ 1.16
Smu1-201ENSMUST00000030117 LifrP42703 1092 aa22.32■■□□□ 1.16
Smu1-201ENSMUST00000030117 Trim28Q62318 834 aa22.32■■□□□ 1.16
Smu1-201ENSMUST00000030117 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa22.32■■□□□ 1.16
Smu1-201ENSMUST00000030117 RereQ80TZ9 1558 aa22.32■■□□□ 1.16
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ankrd44B2RXR6 993 aa22.31■■□□□ 1.16
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 94.7 ms