RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018755.9

Pdlim4-201, Transcript of PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdlim4, Length 1,182 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 CatipB9EKE5 520 aa31.6■■■□□ 2.65
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Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Sbno1Q689Z5 1390 aa31.56■■■□□ 2.64
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Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Col22a1E9Q7P1 1613 aa31.36■■■□□ 2.61
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Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Kcnh5Q920E3 988 aa31.25■■■□□ 2.59
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zeb2Q9R0G7 1215 aa31.25■■■□□ 2.59
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa31.24■■■□□ 2.59
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Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ltbp1Q8CG19 1712 aa31.21■■■□□ 2.59
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Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
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Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Robo1O89026 1612 aa30.87■■■□□ 2.53
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Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
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Pdlim4-201ENSMUST00000018755 OscarQ8VBT3 265 aa30.85■■■□□ 2.53
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