RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	PNMA5	Q96PV4	448 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ELP3	Q9H9T3	547 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	RNF146	Q9NTX7	359 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	WWOX	Q9NZC7	414 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	FZD1	Q9UP38	647 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		6.96	□□□□□ -1.29
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1B0GWJ7	208 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	PP2D1	A8MPX8	630 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	BECN2	A8MW95	431 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	NFIB	O00712	420 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	CHUK	O15111	745 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	DOK2	O60496	412 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	TACC1	O75410	805 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	CLN5	O75503	358 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	SGPL1	O95470	568 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	EOMES	O95936	686 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	APOE	P02649	317 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	ADRB2	P07550	413 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	CLU	P10909	449 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	ATP1A3	P13637	1013 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	POU2F1	P14859	743 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	PLCG1	P19174	1290 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	BMP6	P22004	513 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	CDC25A	P30304	524 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	CDC25B	P30305	580 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	TTK	P33981	857 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	MLH1	P40692	756 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	AFM	P43652	599 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	ASIC1	P78348	528 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	TMPRSS15	P98073	1019 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	COASY	Q13057	564 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	DGKZ	Q13574	1117 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	SPATC1	Q76KD6	591 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	SV2B	Q7L1I2	683 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	CEP97	Q8IW35	865 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	DPP10	Q8N608	796 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	DNER	Q8NFT8	737 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	ATL1	Q8WXF7	558 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	RFFL	Q8WZ73	363 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	MED30	Q96HR3	178 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	SHD	Q96IW2	340 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	CDRT15	Q96T59	188 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	KRT84	Q9NSB2	600 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	COL20A1	Q9P218	1284 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	VAV3	Q9UKW4	847 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	DERA	Q9Y315	318 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	PFAS	O15067	1338 aa		6.96	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	SH3D21	A4FU49	640 aa		6.95	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		6.95	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971		M0R082	166 aa		6.95	□□□□□ -1.3
FBXO38-208	ENST00000504971	TPP1	O14773	563 aa		6.95	□□□□□ -1.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms