RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486941.1

SNRNP40-205, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-205	ENST00000486941	CPT1A	P50416	773 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	SNAP25	P60880	206 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	PSMC6	P62333	389 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TBCC	Q15814	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TICAM2	Q86XR7	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TTC14	Q96N46	770 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	MAF1	Q9H063	256 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	MUC3A	Q02505	3323 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	PIEZO1	Q92508	2521 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	PTPRS	Q13332	1948 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	RAD50	Q92878	1312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	FGA	P02671	866 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	MYL3	P08590	195 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	IQCF3	P0C7M6	154 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	CYP2C9	P11712	490 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	MYOG	P15173	224 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	MX1	P20591	662 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC16A2	P36021	539 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	LIPA	P38571	399 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	BFSP2	Q13515	415 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM153C	Q494X1	144 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	SCFD2	Q8WU76	684 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	EVI5L	Q96CN4	794 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	COG5	Q9UP83	839 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	MYO7A	Q13402	2215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZMYM6	O95789	1325 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	MOSPD3	O75425	235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	BAIAP3	O94812	1187 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	CA3	P07451	260 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	PDHB	P11177	359 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	CALML3	P27482	149 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	EPHB2	P29323	1055 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	NT5C2	P49902	561 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	REV3L	O60673	3130 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941	EPOP	A6NHQ4	379 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNRNP40-205	ENST00000486941		H0YIZ8	118 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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