RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 RTL4Q6ZR62 310 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 MAGEC1O60732 1142 aa6.98□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 ITGA8P53708 1063 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 FCHO2Q0JRZ9 810 aa6.98□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 NR2E1Q9Y466 385 aa6.98□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1B0GV90 55 aa6.98□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa6.98□□□□□ -1.29
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RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGEF1-202ENST00000380828 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.98□□□□□ -1.29
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