RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 CPA4Q9UI42 421 aa16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 TAB1Q15750 504 aa16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 ADRM1Q16186 407 aa16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 SBK1Q52WX2 424 aa16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 DEFB107AQ8IZN7 70 aa16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 CEP41Q9BYV8 373 aa16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 PDP2Q9P2J9 529 aa16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 NDUFAF1Q9Y375 327 aa16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 MYH7BA7E2Y1 1941 aa16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 GUCY1B2O75343 617 aa16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 NEDD8Q15843 81 aa16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 NEK7Q8TDX7 302 aa16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 SMARCD1Q96GM5 515 aa16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 DAPK2Q9UIK4 370 aa16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa16.76■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 MTA1Q13330 715 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 KCNMB4Q86W47 210 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 RORBQ92753 470 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 RUSC1Q9BVN2 902 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 FBXO28Q9NVF7 368 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 MBD2Q9UBB5 411 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 UBDO15205 165 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 STX11O75558 287 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 NR2C2P49116 596 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 SEC24CP53992 1094 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 GRTP1Q5TC63 336 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 CBWD1Q9BRT8 395 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 SLC4A5Q9BY07 1137 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 ITIH4Q14624 930 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 PJA1Q8NG27 643 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 UGT2B28Q9BY64 529 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 COMMD9Q9P000 198 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 PSME2Q9UL46 239 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 BST2Q10589 180 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 FBXO47Q5MNV8 452 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 TPGS1Q6ZTW0 290 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 GPSM3Q9Y4H4 160 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF609O15014 1411 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 OPLAHO14841 1288 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 IQCF2Q8IXL9 164 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 TSPAN14Q8NG11 270 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 NOD2Q9HC29 1040 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 SNX6Q9UNH7 406 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 TRIM66O15016 1216 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 MFN2O95140 757 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 ITGA1P56199 1179 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 RIBC2Q9H4K1 309 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 CATSPERZQ9NTU4 200 aa16.75■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 ARHGDIBP52566 201 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 TRIM63Q969Q1 353 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 TMEM138Q9NPI0 162 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 ABCA8O94911 1581 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 MICAL2O94851 1124 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 LLGL2Q6P1M3 1020 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF605Q86T29 641 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 OR52L1Q8NGH7 329 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 ITGA11Q9UKX5 1188 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 SRP54P61011 504 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 TAF5Q15542 800 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 PANX3Q96QZ0 392 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 ATP1A4Q13733 1029 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 GANQ9H2C0 597 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 IQGAP3Q86VI3 1631 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 CRABP2P29373 138 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 CD151P48509 253 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 OLFML2AQ68BL7 652 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 PXMP2Q9NR77 195 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 MGRN1O60291 552 aa16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 NQO1P15559 274 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
LAMC1-201ENST00000258341 PLK1P53350 603 aa16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms