RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053785.9

Trpc1-201, Transcript of Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trpc1, Length 2,912 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Gm4846B2RWH8 538 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Sema6aO35464 1031 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 LdlrP35951 862 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 St14P56677 855 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Arl1P61211 181 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 MamstrQ0ZCJ7 421 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Cpne9Q1RLL3 553 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Wdr36Q3TAQ9 899 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Trim38Q5SZ99 471 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Stxbp2Q64324 593 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Tdpoz2Q717B2 364 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Slc39a14Q75N73 489 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Tmem198Q8BG75 360 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Dapk2Q8VDF3 370 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Trpv6Q91WD2 767 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Pcdha2Q91Y17 948 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 KlbQ99N32 1043 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 S100a14Q9D2Q8 104 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Hmgn3Q9DCB1 99 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 PllpQ9DCU2 182 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Aqp5Q9WTY4 265 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Cldn24D3YXJ9 220 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Dlx2P40764 332 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Mxd1P50538 227 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Kcnj8P97794 424 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Q3UE31 404 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Cgrrf1Q8BMJ7 332 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Cnpy4Q8BQ47 245 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Il33Q8BVZ5 266 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Sfrp1Q8C4U3 314 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Fam204aQ8C6C7 236 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Crtc3Q91X84 619 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Pcdhgb1Q91XX8 918 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 HlcsQ920N2 722 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Bcas2Q9D287 225 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Fem1bQ9Z2G0 627 aa20.4■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Klhl18A0A0G2JGN5 579 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Fam43bA2AM80 330 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Npr3P70180 536 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 TgfbiP82198 683 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 NxnP97346 435 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Hk3Q3TRM8 922 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Zmym5Q3U2E2 627 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Rbm44Q3V089 1013 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Psg28Q4KL66 472 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Tom1l2Q5SRX1 507 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Cdh7Q8BM92 785 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Ttc4Q8R3H9 386 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Retreg1dQ8VE91 480 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Ttc25Q9D4B2 624 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Tmx2Q9D710 295 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Ccdc103Q9D9P2 237 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Gm3752A6NAT4 150 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Kcnt2D3Z649 1135 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Nedd8P29595 81 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Cdc25bP30306 576 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Ripply1Q2WG77 201 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Zfp759Q7M6X3 721 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Supt20hQ7TT00 530 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Ugt2a1Q80X89 528 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Thnsl1Q8BH55 747 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 EtnpplQ8BWU8 499 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Sulf1Q8K007 870 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Q9D2Q3 444 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Tex47Q9D5W8 253 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 PigqQ9QYT7 581 aa20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Zc3h4Q6ZPZ3 1304 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Vmn2r70K7N702 854 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Vmn2r44L7N2E1 861 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Kng1O08677 661 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Cdh1P09803 884 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Atp6v0d1P51863 351 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Sarm1Q6PDS3 724 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Actr5Q80US4 605 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Ccdc32Q8BS39 179 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 TbcdQ8BYA0 1196 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Plbd1Q8VCI0 550 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Tas1r2Q925I4 843 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Plpp6Q9D4F2 292 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Kmt2eQ3UG20 1868 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Col2a1P28481 1487 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Prss51A0A286YDY8 319 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Gcnt4E9Q649 455 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Mroh4G3X8W1 983 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Gm10436L7N1Y3 520 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Crabp2P22935 138 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 NppbP40753 121 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Heatr9Q5QNV8 569 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Ergic3Q9CQE7 383 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Tma16Q9CR02 221 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Arhgef25Q9CWR0 618 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Dhrs7Q9CXR1 338 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Trpc2Q9R244 1172 aa20.38■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Arhgef26D3YYY8 869 aa20.37■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Vmn2r61L7N2B8 865 aa20.37■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Akap3O88987 864 aa20.37■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Hoxa2P31245 372 aa20.37■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 SnrpfP62307 86 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Trpc1-201ENSMUST00000053785 SirpaP97797 513 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.2 ms