RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Il1rapl1P59823 695 aa20.28■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ptprn2P80560 1001 aa20.28■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gabpb1Q00420 383 aa20.28■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trim80Q3V061 624 aa20.28■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cntn2Q61330 1040 aa20.28■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cpa4Q6P8K8 420 aa20.28■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 MroQ7TNB4 248 aa20.28■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cyp4a12aQ91WL5 508 aa20.28■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pip4k2cQ91XU3 421 aa20.28■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trmt11Q9CWH5 460 aa20.28■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Commd8Q9CZG3 183 aa20.28■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q9DA42 136 aa20.28■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccr10Q9JL21 362 aa20.28■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ror1Q9Z139 937 aa20.28■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dock3Q8CIQ7 2027 aa20.27■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp839E9PUU5 921 aa20.27■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Serpine3E9Q6A2 401 aa20.27■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Oaz2O08608 189 aa20.27■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Serpina6Q06770 397 aa20.27■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cldn11Q60771 207 aa20.27■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prdm4Q80V63 803 aa20.27■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trim62Q80V85 475 aa20.27■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ubap1Q8BH48 502 aa20.27■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gtf3c4Q8BMQ2 817 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Scara3Q8C850 606 aa20.27■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 KyQ8C8H8 661 aa20.27■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm5591Q8CDK1 855 aa20.27■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tada2aQ8CHV6 443 aa20.27■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Eif2b5Q8CHW4 717 aa20.27■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hmgcll1Q8JZS7 343 aa20.27■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atpaf2Q91YY4 289 aa20.27■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mrps22Q9CXW2 359 aa20.27■□□□□ 0.84
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Usp51B1AY15 661 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Akain1G3UWD5 69 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Exoc7O35250 697 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfy1P10925 782 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mansc4Q3UU94 337 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trcg1Q58Y74 825 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 RilpQ5ND29 369 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm11487Q5RIS0 354 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 GstcdQ5RL51 634 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gpr65Q61038 337 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prr18Q6PAN7 307 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ctxn3Q8BXZ0 80 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 HpdlQ8K248 371 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vwa1Q8R2Z5 415 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kif12Q9D2Z8 642 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 4930449I24RikQ9D5E3 319 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Arid3bQ9Z1N7 568 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PtprfA2A8L5 1898 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Igkv5-43A0A0B4J1J2 115 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp212G3X8R7 492 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Oprl1P35377 367 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Psen1P49769 467 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ephb2P54763 986 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1198Q7TR12 308 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pcsk9Q80W65 694 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf365Q8BG89 408 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lrrc42Q8R2U7 421 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Caap1Q8VDY9 356 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rfc5Q9D0F6 339 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Taf7lQ9D3R9 471 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mrps9Q9D7N3 390 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Oma1Q9D8H7 521 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pgam1Q9DBJ1 254 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 EtfbQ9DCW4 255 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ddx21Q9JIK5 851 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Crlf3Q9Z2L7 442 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf106O88466 1888 aa20.26■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 4930558K02RikE0CXC6 182 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm3383J3QQ59 259 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Odc1P00860 461 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ap2a1P17426 977 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Usp46P62069 366 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tespa1Q3U132 458 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nomo1Q6GQT9 1214 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 ShbQ6PD21 503 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr533Q7TRT7 320 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr412Q7TRW7 312 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Frmd4aQ8BIE6 1020 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 GancQ8BVW0 898 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dclre1bQ8C7W7 541 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccdc63Q8CDV6 558 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wrnip1Q91XU0 660 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccdc182Q9D9C6 152 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PllpQ9DCU2 182 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 GabrqQ9JLF1 638 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Msh5Q9QUM7 833 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm28360A0A087WR25 190 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn2r27D3YUK6 857 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pcsk6F6XJP7 959 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Morc3F7BJB9 942 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn2r88L7N1W8 857 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trove2O08848 538 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Arpp19P56212 112 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 DsppP97399 934 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Brms1lQ3U1T3 323 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Acbd5Q5XG73 508 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mon1aQ6PDG8 556 aa20.25■□□□□ 0.83
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc2a12Q8BFW9 622 aa20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29 ms