Protein–RNA interactions for Protein: Q91XU3

Pip4k2c, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 gamma, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2cQ91XU3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.07■■■■■ 4.17
Pip4k2cQ91XU3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Pip4k2cQ91XU3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Pip4k2cQ91XU3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Pip4k2cQ91XU3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Pip4k2cQ91XU3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Pip4k2cQ91XU3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Pip4k2cQ91XU3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Pip4k2cQ91XU3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Pip4k2cQ91XU3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Pip4k2cQ91XU3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Pip4k2cQ91XU3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Pip4k2cQ91XU3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Pip4k2cQ91XU3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pip4k2cQ91XU3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Pip4k2cQ91XU3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pip4k2cQ91XU3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Pip4k2cQ91XU3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pip4k2cQ91XU3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Pip4k2cQ91XU3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Pip4k2cQ91XU3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pip4k2cQ91XU3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pip4k2cQ91XU3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Pip4k2cQ91XU3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Pip4k2cQ91XU3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Pip4k2cQ91XU3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pip4k2cQ91XU3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pip4k2cQ91XU3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pip4k2cQ91XU3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Pip4k2cQ91XU3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Pip4k2cQ91XU3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Pip4k2cQ91XU3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Pip4k2cQ91XU3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Pip4k2cQ91XU3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Pip4k2cQ91XU3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Pip4k2cQ91XU3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Pip4k2cQ91XU3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Pip4k2cQ91XU3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Pip4k2cQ91XU3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Pip4k2cQ91XU3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Pip4k2cQ91XU3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Pip4k2cQ91XU3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Pip4k2cQ91XU3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Pip4k2cQ91XU3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Pip4k2cQ91XU3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Pip4k2cQ91XU3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Pip4k2cQ91XU3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Pip4k2cQ91XU3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Pip4k2cQ91XU3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Pip4k2cQ91XU3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Pip4k2cQ91XU3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Pip4k2cQ91XU3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Pip4k2cQ91XU3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Pip4k2cQ91XU3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Pip4k2cQ91XU3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Pip4k2cQ91XU3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Pip4k2cQ91XU3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Pip4k2cQ91XU3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pip4k2cQ91XU3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pip4k2cQ91XU3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Pip4k2cQ91XU3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pip4k2cQ91XU3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pip4k2cQ91XU3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Pip4k2cQ91XU3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Pip4k2cQ91XU3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Pip4k2cQ91XU3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Pip4k2cQ91XU3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Pip4k2cQ91XU3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Pip4k2cQ91XU3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pip4k2cQ91XU3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pip4k2cQ91XU3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pip4k2cQ91XU3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pip4k2cQ91XU3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pip4k2cQ91XU3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pip4k2cQ91XU3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pip4k2cQ91XU3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Pip4k2cQ91XU3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Pip4k2cQ91XU3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Pip4k2cQ91XU3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pip4k2cQ91XU3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pip4k2cQ91XU3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Pip4k2cQ91XU3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pip4k2cQ91XU3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Pip4k2cQ91XU3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pip4k2cQ91XU3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Pip4k2cQ91XU3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pip4k2cQ91XU3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pip4k2cQ91XU3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pip4k2cQ91XU3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pip4k2cQ91XU3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pip4k2cQ91XU3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pip4k2cQ91XU3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pip4k2cQ91XU3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pip4k2cQ91XU3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Pip4k2cQ91XU3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pip4k2cQ91XU3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pip4k2cQ91XU3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Pip4k2cQ91XU3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Pip4k2cQ91XU3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pip4k2cQ91XU3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms