Protein–RNA interactions for Protein: F6XJP7

Pcsk6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk6F6XJP7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39,85■■■■□ 3,97
Pcsk6F6XJP7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Pcsk6F6XJP7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Pcsk6F6XJP7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Pcsk6F6XJP7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35,01■■■■□ 3,2
Pcsk6F6XJP7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,48■■■■□ 3,11
Pcsk6F6XJP7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,42■■■■□ 3,1
Pcsk6F6XJP7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,3■■■■□ 3,08
Pcsk6F6XJP7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Pcsk6F6XJP7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Pcsk6F6XJP7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Pcsk6F6XJP7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Pcsk6F6XJP7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,31■■■□□ 2,92
Pcsk6F6XJP7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Pcsk6F6XJP7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Pcsk6F6XJP7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,79■■■□□ 2,84
Pcsk6F6XJP7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Pcsk6F6XJP7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Pcsk6F6XJP7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Pcsk6F6XJP7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Pcsk6F6XJP7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,39■■■□□ 2,78
Pcsk6F6XJP7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Pcsk6F6XJP7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Pcsk6F6XJP7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Pcsk6F6XJP7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Pcsk6F6XJP7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
Pcsk6F6XJP7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,11■■■□□ 2,73
Pcsk6F6XJP7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32,09■■■□□ 2,73
Pcsk6F6XJP7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Pcsk6F6XJP7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,86■■■□□ 2,69
Pcsk6F6XJP7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,63■■■□□ 2,65
Pcsk6F6XJP7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Pcsk6F6XJP7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,56■■■□□ 2,64
Pcsk6F6XJP7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Pcsk6F6XJP7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Pcsk6F6XJP7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Pcsk6F6XJP7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,41■■■□□ 2,62
Pcsk6F6XJP7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Pcsk6F6XJP7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,36■■■□□ 2,61
Pcsk6F6XJP7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Pcsk6F6XJP7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Pcsk6F6XJP7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Pcsk6F6XJP7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Pcsk6F6XJP7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,99■■■□□ 2,55
Pcsk6F6XJP7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Pcsk6F6XJP7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,86■■■□□ 2,53
Pcsk6F6XJP7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Pcsk6F6XJP7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Pcsk6F6XJP7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,78■■■□□ 2,52
Pcsk6F6XJP7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,75■■■□□ 2,51
Pcsk6F6XJP7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Pcsk6F6XJP7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Pcsk6F6XJP7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Pcsk6F6XJP7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Pcsk6F6XJP7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Pcsk6F6XJP7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Pcsk6F6XJP7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Pcsk6F6XJP7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Pcsk6F6XJP7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Pcsk6F6XJP7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Pcsk6F6XJP7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Pcsk6F6XJP7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Pcsk6F6XJP7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Pcsk6F6XJP7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,26■■■□□ 2,43
Pcsk6F6XJP7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,23■■■□□ 2,43
Pcsk6F6XJP7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Pcsk6F6XJP7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Pcsk6F6XJP7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Pcsk6F6XJP7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Pcsk6F6XJP7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Pcsk6F6XJP7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Pcsk6F6XJP7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Pcsk6F6XJP7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30,06■■■□□ 2,4
Pcsk6F6XJP7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Pcsk6F6XJP7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Pcsk6F6XJP7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,98■■■□□ 2,39
Pcsk6F6XJP7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Pcsk6F6XJP7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Pcsk6F6XJP7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Pcsk6F6XJP7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,84■■■□□ 2,37
Pcsk6F6XJP7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
Pcsk6F6XJP7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Pcsk6F6XJP7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Pcsk6F6XJP7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Pcsk6F6XJP7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Pcsk6F6XJP7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Pcsk6F6XJP7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Pcsk6F6XJP7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Pcsk6F6XJP7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Pcsk6F6XJP7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Pcsk6F6XJP7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
Pcsk6F6XJP7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Pcsk6F6XJP7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Pcsk6F6XJP7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Pcsk6F6XJP7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Pcsk6F6XJP7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Pcsk6F6XJP7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Pcsk6F6XJP7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Pcsk6F6XJP7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Pcsk6F6XJP7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
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