RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 SAR1AQ9NR31 198 aa21.78■■□□□ 1.08
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PTPRM-211ENST00000580170 GAKO14976 1311 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 ATG7O95352 703 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 CDC25CP30307 473 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 BFSP2Q13515 415 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 CYP2R1Q6VVX0 501 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 TRPC4APQ8TEL6 797 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 TRHDEQ9UKU6 1024 aa21.78■■□□□ 1.08
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PTPRM-211ENST00000580170 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa21.77■■□□□ 1.08
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PTPRM-211ENST00000580170 KRT6BP04259 564 aa21.77■■□□□ 1.08
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PTPRM-211ENST00000580170 SETD4Q9NVD3 440 aa21.77■■□□□ 1.08
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PTPRM-211ENST00000580170 HACD1B0YJ81 288 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 VAPBO95292 243 aa21.77■■□□□ 1.08
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PTPRM-211ENST00000580170 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa21.77■■□□□ 1.08
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PTPRM-211ENST00000580170 FAM25AB3EWG3 89 aa21.77■■□□□ 1.08
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PTPRM-211ENST00000580170 FAM25GB3EWG6 89 aa21.77■■□□□ 1.08
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PTPRM-211ENST00000580170 KATNAL2Q8IYT4 538 aa21.77■■□□□ 1.08
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PTPRM-211ENST00000580170 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.76■■□□□ 1.07
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PTPRM-211ENST00000580170 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
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PTPRM-211ENST00000580170 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 CDK7P50613 346 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 OR56A4Q8NGH8 313 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRM-211ENST00000580170 RMI1Q9H9A7 625 aa21.75■■□□□ 1.07
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