RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534106.2

CHMP4A-208, Transcript of charged multivesicular body protein 4A, humanhuman

TSL 5

Gene CHMP4A, Length 370 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4A-208ENST00000534106 RDXP35241 583 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 PTENP60484 403 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 CDC42EP1Q00587 391 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 CREMQ03060 361 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 MBTD1Q05BQ5 628 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 MYO1EQ12965 1108 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 GRIK3Q13003 919 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 TRDNQ13061 729 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 TUSC3Q13454 348 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 LY6DQ14210 128 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 LRCH2Q5VUJ6 765 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 TCTN3Q6NUS6 607 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 Q6ZUG5 572 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 GAREM2Q75VX8 874 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 MAEAQ7L5Y9 396 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 TMC8Q8IU68 726 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 FMNL3Q8IVF7 1028 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 TCEAL8Q8IYN2 117 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 SYNPOQ8N3V7 929 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 HDDC3Q8N4P3 179 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 MINDY1Q8N5J2 469 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 CAMKK1Q8N5S9 505 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 CNNM3Q8NE01 707 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 TSTD1Q8NFU3 115 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 EXOC6Q8TAG9 804 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 SLC5A5Q92911 643 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 CCDC136Q96JN2 1154 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 CEP170P1Q96L14 293 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 TCEANC2Q96MN5 208 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 PGLYRP2Q96PD5 576 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 SLC46A2Q9BY10 475 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 TRIM4Q9C037 500 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 LINC00597Q9H2U6 94 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 RGL1Q9NZL6 768 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 ASH2LQ9UBL3 628 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 ZFP69BQ9UJL9 534 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 SRPK3Q9UPE1 567 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 GDAQ9Y2T3 454 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 NUB1Q9Y5A7 615 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 EVPLQ92817 2033 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 PATJQ8NI35 1801 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 MYH15Q9Y2K3 1946 aa3.25□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 ZFHX3Q15911 3703 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 A0A1B0GUA9 196 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 CCDC69A6NI79 296 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 K7EQS6 105 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 PLK4O00444 970 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 KCNK3O14649 394 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 TBX1O43435 398 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 OPHN1O60890 802 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 DTNBO60941 627 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 CBFA2T3O75081 653 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 PSMD10O75832 226 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 KRT38O76015 456 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 RECQL4O94761 1208 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 ERLIN2O94905 339 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 TDP2O95551 362 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 EDN1P05305 212 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 CKMP06732 381 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 THP07101 528 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 GLRA2P23416 452 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 NMT1P30419 496 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 CIITAP33076 1130 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 GJA4P35212 333 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 ABCG1P45844 678 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 GNAQP50148 359 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 EPHA5P54756 1037 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 RAC3P60763 192 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 SEMG2Q02383 582 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 LMAN2Q12907 356 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 RUNX3Q13761 415 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 CAPSQ13938 189 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 EMC2Q15006 297 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 SF1Q15637 639 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 MAPK6Q16659 721 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 UPP1Q16831 310 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 SKIDA1Q1XH10 827 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 CTXN3Q4LDR2 81 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 XKR9Q5GH70 373 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 MIIPQ5JXC2 388 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 GPR158Q5T848 1215 aa3.24□□□□□ -1.89
CHMP4A-208ENST00000534106 TXNDC8Q6A555 127 aa3.24□□□□□ -1.89
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