RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464936.5

CEP170-209, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 5

Gene CEP170, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-209	ENST00000464936	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	GDE1	Q9NZC3	331 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ARL5C	A6NH57	179 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936		F8W810	466 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PCDHGA12	O60330	932 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ECI2	O75521	394 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	KCNK5	O95279	499 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	FAH	P16930	419 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	HOXA9	P31269	272 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	SFN	P31947	248 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	MCM5	P33992	734 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	SCNN1G	P51170	649 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	LIMK1	P53667	647 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ANTXR2	P58335	489 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	SATB1	Q01826	763 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ADAM9	Q13443	819 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	DRP2	Q13474	957 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	BIRC2	Q13490	618 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	CCDC6	Q16204	474 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	XKR3	Q5GH77	459 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PHF19	Q5T6S3	580 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	SPRED1	Q7Z699	444 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	GPR65	Q8IYL9	337 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	CNNM3	Q8NE01	707 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	FAM3C	Q92520	227 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	IL25	Q9H293	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	DTL	Q9NZJ0	730 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ACOT7	O00154	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PRRG1	O14668	218 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF263	O14978	683 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	APOL3	O95236	402 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	RHO	P08100	348 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	CYP3A4	P08684	503 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF806	P0C7X5	589 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	CCDC192	P0DO97	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PF4V1	P10720	104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	TDGF1	P13385	188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ENPP1	P22413	925 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	GDI1	P31150	447 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PTH1R	Q03431	593 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	DSC1	Q08554	894 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ODF1	Q14990	250 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PSMD5	Q16401	504 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	UGCG	Q16739	394 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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