RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461018.5

CNN3-204, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-204ENST00000461018 ITGA1P56199 1179 aa4.75□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 NLRP5P59047 1200 aa4.75□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 CDC42EP1Q00587 391 aa4.75□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 GRIN1Q05586 938 aa4.75□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 FCHO2Q0JRZ9 810 aa4.75□□□□□ -1.65
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CNN3-204ENST00000461018 C2orf27AQ580R0 203 aa4.75□□□□□ -1.65
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CNN3-204ENST00000461018 SYT13Q7L8C5 426 aa4.75□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 TTC30AQ86WT1 665 aa4.75□□□□□ -1.65
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CNN3-204ENST00000461018 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa4.75□□□□□ -1.65
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CNN3-204ENST00000461018 RSPH1Q8WYR4 309 aa4.75□□□□□ -1.65
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CNN3-204ENST00000461018 ZNF577Q9BSK1 485 aa4.75□□□□□ -1.65
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CNN3-204ENST00000461018 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
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CNN3-204ENST00000461018 EPB41L1Q9H4G0 881 aa4.75□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 MINDY3Q9H8M7 445 aa4.75□□□□□ -1.65
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CNN3-204ENST00000461018 HPS4Q9NQG7 708 aa4.75□□□□□ -1.65
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CNN3-204ENST00000461018 MYOTQ9UBF9 498 aa4.75□□□□□ -1.65
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CNN3-204ENST00000461018 PFDN2Q9UHV9 154 aa4.75□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 BTBD3Q9Y2F9 522 aa4.75□□□□□ -1.65
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CNN3-204ENST00000461018 MYLKQ15746 1914 aa4.75□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa4.74□□□□□ -1.65
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CNN3-204ENST00000461018 ARHGEF37A1IGU5 675 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 CLEC18AA5D8T8 446 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 I3L4J1 428 aa4.74□□□□□ -1.65
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CNN3-204ENST00000461018 AKAP5P24588 427 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 P2RY2P41231 377 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 JAK3P52333 1124 aa4.74□□□□□ -1.65
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CNN3-204ENST00000461018 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
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CNN3-204ENST00000461018 DUOXA1Q1HG43 343 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 CR1LQ2VPA4 569 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 PRR16Q569H4 304 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa4.74□□□□□ -1.65
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CNN3-204ENST00000461018 PPP4R3AQ6IN85 833 aa4.74□□□□□ -1.65
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CNN3-204ENST00000461018 CLEC18BQ6UXF7 455 aa4.74□□□□□ -1.65
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CNN3-204ENST00000461018 CATSPER4Q7RTX7 472 aa4.74□□□□□ -1.65
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CNN3-204ENST00000461018 SFTPA1Q8IWL2 248 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 EXOC8Q8IYI6 725 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 GPR65Q8IYL9 337 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 BLIDQ8IZY5 108 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 Q8N1Y9 231 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 CCDC33Q8N5R6 958 aa4.74□□□□□ -1.65
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CNN3-204ENST00000461018 TSTD1Q8NFU3 115 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
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CNN3-204ENST00000461018 LENG9Q96B70 501 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 PGBD4Q96DM1 585 aa4.74□□□□□ -1.65
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