RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438547.6

SEMA4D-211, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA4D, Length 4,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-211ENST00000438547 SPATA13Q96N96 652 aa11.42□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 RNF157Q96PX1 679 aa11.42□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 ROBO3Q96MS0 1386 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 MAPK1P28482 360 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 CCT8P50990 548 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 STK32CQ86UX6 486 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 REPS2Q8NFH8 660 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 ADAM32Q8TC27 787 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 C9orf16Q9BUW7 83 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 NMRK2Q9NPI5 230 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 MPP6Q9NZW5 540 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 AHCYL1O43865 530 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 RENBPP51606 427 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 ST8SIA6P61647 398 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 NRF1Q16656 503 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 GSTA3Q16772 222 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 DACT2Q5SW24 774 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 DHDDSQ86SQ9 333 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 FBXO39Q8N4B4 442 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 RNF145Q96MT1 663 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 PCDHB18PQ96TA0 734 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 VAT1Q99536 393 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 SPATC1LQ9H0A9 340 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 ATXN3LQ9H3M9 355 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 DCDC2CA8MYV0 355 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 ARIH2O95376 493 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 ADARP55265 1226 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 OXCT1P55809 520 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 CRADDP78560 199 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 CXCL9Q07325 125 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 ATP1A4Q13733 1029 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 VSIG10LQ86VR7 867 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 TBC1D19Q8N5T2 526 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 RGS18Q9NS28 235 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 ZMPSTE24O75844 475 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 COX4I1P13073 169 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 NT5DC4Q86YG4 428 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 HOMEZQ8IX15 550 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 MAGED4Q96JG8 741 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 PIDD1Q9HB75 910 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 PACSIN3Q9UKS6 424 aa11.41□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC12A8A0AV02 714 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 WFS1O76024 890 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 CETPP11597 493 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC2A4P14672 509 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 PSMB9P28065 219 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 SOX6P35712 828 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 OAZ1P54368 228 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 CDH18Q13634 790 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 PDK3Q15120 406 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 CCDC142Q17RM4 750 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 UNC5AQ6ZN44 842 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 ACMSDQ8TDX5 336 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 ZFYVE19Q96K21 471 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 ACOX2Q99424 681 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 PHACTR1Q9C0D0 580 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 IKZF4Q9H2S9 585 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 CDHR5Q9HBB8 845 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 PTPRHQ9HD43 1115 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 CYLDQ9NQC7 956 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 SYBUQ9NX95 663 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 PEX1O43933 1283 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 PGM3O95394 542 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 ASS1P00966 412 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 SERPINF2P08697 491 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 HOXD10P28358 340 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 PGS1Q32NB8 556 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 LZTR1Q8N653 840 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 LRRC57Q8N9N7 239 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 FNDC5Q8NAU1 212 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM13CQ8NE31 585 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 OR52K1Q8NGK4 314 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 FIG4Q92562 907 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 BHMTQ93088 406 aa11.4□□□□□ -0.58
SEMA4D-211ENST00000438547 CERS2Q96G23 380 aa11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms