RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379599.6

NHLRC3-201, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLRC3, Length 3,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-201ENST00000379599 FSCN2O14926 492 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 DCXO43602 365 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 ENTPD3O75355 529 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 OR7A10O76100 309 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 ALDH1A2O94788 518 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 YAP1P46937 504 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 CHRNA2Q15822 529 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 TRIB2Q92519 343 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC39A13Q96H72 371 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 APOPT1Q96IL0 206 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF597Q96LX8 424 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 MMP19Q99542 508 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 C17orf62Q9BQA9 187 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 CLSTN3Q9BQT9 956 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 TOR3AQ9H497 397 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 TIGARQ9NQ88 270 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 CNNM1Q9NRU3 951 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 HOMER2Q9NSB8 354 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 TMEM9Q9P0T7 183 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 PCSK1NQ9UHG2 260 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 TEKT2Q9UIF3 430 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 DNAJC12Q9UKB3 198 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 SORCS3Q9UPU3 1222 aa8.71□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 NID2Q14112 1375 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 TNRQ92752 1358 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 POTEB3A0JP26 581 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 A8MUA0 341 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 TRIM77I1YAP6 450 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 KRT18P05783 430 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 TMEM191BP0C7N4 346 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 AKR1B1P15121 316 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 GARTP22102 1010 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 FMO4P31512 558 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 HAAOP46952 286 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 NT5C2P49902 561 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 ALCAMQ13740 583 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 MTX3Q5HYI7 312 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 SHEQ5VZ18 495 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 POTEBQ6S5H4 581 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 PALM2Q8IXS6 379 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 ANKRD53Q8N9V6 530 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 LRTOMTQ8WZ04 291 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 ATP6V1E2Q96A05 226 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 MAGED4Q96JG8 741 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 SERAC1Q96JX3 654 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 TTYH2Q9BSA4 534 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 MTRRQ9UBK8 725 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 PDZK1P1A8MUH7 402 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 FAM25AB3EWG3 89 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 FAM25CB3EWG5 89 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 FAM25GB3EWG6 89 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC22A1O15245 554 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 GCATO75600 419 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 CLIC3O95833 236 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 CKMT2P17540 419 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 CCND2P30279 289 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 ETV4P43268 484 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 RCAN1P53805 252 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 GPS1Q13098 491 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 GRB10Q13322 594 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 UBE3CQ15386 1083 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 EFHC2Q5JST6 749 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 PDPK2PQ6A1A2 396 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF600Q6ZNG1 722 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 POLNQ7Z5Q5 900 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 SLCO6A1Q86UG4 719 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 RELL1Q8IUW5 271 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 OR2T3Q8NH03 318 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 ETNPPLQ8TBG4 499 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 CYGBQ8WWM9 190 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 MARK4Q96L34 752 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 DACH2Q96NX9 599 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 ITM2CQ9NQX7 267 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 FBXO40Q9UH90 709 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.7□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 SERPINI2O75830 405 aa8.69□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 TOMM70O94826 608 aa8.69□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 CD4P01730 458 aa8.69□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 COX4I1P13073 169 aa8.69□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 JAM2P57087 298 aa8.69□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 C16orf46Q6P387 395 aa8.69□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 HID1Q8IV36 788 aa8.69□□□□□ -1.02
NHLRC3-201ENST00000379599 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms