RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc81Q9D5W4 654 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ldlrad1D3YYZ1 218 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adam15O88839 864 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arl4cP61208 192 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dact3Q0PHV7 610 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Krt42Q6IFX2 452 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Casd1Q7TN73 797 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vipas39Q8BGQ1 491 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 PvrQ8K094 408 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kbtbd12Q9D618 625 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 MkksQ9JI70 570 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mbd1Q9Z2E2 636 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Siah3B2RWG3 268 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp94E9Q6Y4 486 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Exoc7O35250 697 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 DesP31001 469 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hspa9P38647 679 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ddr1Q03146 911 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ceacam5Q3UKK2 947 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fbxl21Q8BFZ4 434 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rassf2Q8BMS9 326 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Aldh4a1Q8CHT0 562 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ube2q2Q8K2Z8 378 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 MefvQ9JJ26 767 aa12.1□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Usp51B1AY15 661 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dpysl2O08553 572 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cd160O88875 185 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 PrlrQ08501 608 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mkl1Q8K4J6 964 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smim14Q91VT8 99 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lpin1Q91ZP3 924 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q9D1F3 157 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 AuhQ9JLZ3 314 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cep290Q6A078 2472 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Alpk2Q91ZB0 2144 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm28510A0A087WP28 240 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bfsp1A2AMT1 669 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pdk4O70571 412 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 SrgnP13609 152 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Col6a1Q04857 1025 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Faf2Q3TDN2 445 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pyroxd1Q3TMV7 498 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gcnt3Q5JCT0 437 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eif2b4Q61749 524 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ip6k2Q80V72 448 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rnf187Q8BFX1 236 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hspbap1Q8BK58 483 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc25a3Q8VEM8 357 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 4930449I24RikQ9D5E3 319 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myo16Q5DU14 1919 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf518bB2RRE4 1077 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr414E9Q5P8 317 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hsd17b7O88736 334 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adcyap1r1P70205 496 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 PomkQ3TUA9 349 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Paqr9Q6TCG2 375 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Abcg2Q7TMS5 657 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gpr62Q80UC6 358 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ticam2Q8BJQ4 232 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smad3Q8BUN5 425 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tbc1d14Q8CGA2 694 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ddx18Q8K363 660 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hars2Q99KK9 505 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Isl2Q9CXV0 359 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tssk3Q9D2E1 268 aa12.09□□□□□ -0.47
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01648 108 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcnn2P58390 839 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fmo3P97501 534 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 March9Q3TZ87 348 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rnf40Q3U319 1001 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gpr19Q61121 415 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 DbhQ64237 622 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rbl2Q64700 1135 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wnk4Q80UE6 1222 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q810S2 196 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Epb41l5Q8BGS1 731 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf76Q8BMU0 568 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nop56Q9D6Z1 580 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc25a19Q9DAM5 318 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plod1Q9R0E2 728 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Scn5aQ9JJV9 2019 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igkv5-43A0A0B4J1J2 115 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 C7D3YXF5 845 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Akain1G3UWD5 69 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Capn6O35646 641 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp2a2O55143 1044 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myl4P09541 193 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stat5aP42230 793 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zyg11bQ3UFS0 744 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf583Q3V080 568 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 StilQ60988 1262 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ric8bQ80XE1 520 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Afap1l1Q8BZI0 768 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim61Q8JZK6 461 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 FgbQ8K0E8 481 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Usp3Q91W36 520 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 MceeQ9D1I5 178 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ephx1Q9D379 455 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pld1Q9Z280 1074 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm29133A0A1B0GT72 266 aa12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29 ms