Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMS9

Rassf2, Ras association domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf2Q8BMS9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Rassf2Q8BMS9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,5■■■■□ 3,11
Rassf2Q8BMS9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Rassf2Q8BMS9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,84■■■■□ 3,01
Rassf2Q8BMS9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Rassf2Q8BMS9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,61■■■□□ 2,97
Rassf2Q8BMS9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Rassf2Q8BMS9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Rassf2Q8BMS9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Rassf2Q8BMS9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Rassf2Q8BMS9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Rassf2Q8BMS9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Rassf2Q8BMS9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Rassf2Q8BMS9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Rassf2Q8BMS9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Rassf2Q8BMS9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Rassf2Q8BMS9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,35■■■□□ 2,61
Rassf2Q8BMS9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Rassf2Q8BMS9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,25■■■□□ 2,59
Rassf2Q8BMS9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Rassf2Q8BMS9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Rassf2Q8BMS9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,85■■■□□ 2,53
Rassf2Q8BMS9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Rassf2Q8BMS9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Rassf2Q8BMS9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Rassf2Q8BMS9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Rassf2Q8BMS9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Rassf2Q8BMS9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Rassf2Q8BMS9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Rassf2Q8BMS9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Rassf2Q8BMS9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,34■■■□□ 2,45
Rassf2Q8BMS9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Rassf2Q8BMS9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Rassf2Q8BMS9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,31■■■□□ 2,44
Rassf2Q8BMS9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Rassf2Q8BMS9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,26■■■□□ 2,44
Rassf2Q8BMS9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,25■■■□□ 2,43
Rassf2Q8BMS9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Rassf2Q8BMS9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,42
Rassf2Q8BMS9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Rassf2Q8BMS9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Rassf2Q8BMS9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Rassf2Q8BMS9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Rassf2Q8BMS9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Rassf2Q8BMS9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Rassf2Q8BMS9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Rassf2Q8BMS9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Rassf2Q8BMS9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Rassf2Q8BMS9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Rassf2Q8BMS9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Rassf2Q8BMS9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Rassf2Q8BMS9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Rassf2Q8BMS9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Rassf2Q8BMS9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Rassf2Q8BMS9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Rassf2Q8BMS9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Rassf2Q8BMS9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Rassf2Q8BMS9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Rassf2Q8BMS9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Rassf2Q8BMS9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Rassf2Q8BMS9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Rassf2Q8BMS9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,18■■■□□ 2,26
Rassf2Q8BMS9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Rassf2Q8BMS9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Rassf2Q8BMS9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Rassf2Q8BMS9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Rassf2Q8BMS9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Rassf2Q8BMS9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Rassf2Q8BMS9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Rassf2Q8BMS9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Rassf2Q8BMS9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Rassf2Q8BMS9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Rassf2Q8BMS9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Rassf2Q8BMS9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Rassf2Q8BMS9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Rassf2Q8BMS9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,2
Rassf2Q8BMS9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,74■■■□□ 2,19
Rassf2Q8BMS9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Rassf2Q8BMS9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Rassf2Q8BMS9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Rassf2Q8BMS9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Rassf2Q8BMS9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Rassf2Q8BMS9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Rassf2Q8BMS9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Rassf2Q8BMS9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Rassf2Q8BMS9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Rassf2Q8BMS9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Rassf2Q8BMS9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Rassf2Q8BMS9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
Rassf2Q8BMS9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Rassf2Q8BMS9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Rassf2Q8BMS9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Rassf2Q8BMS9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Rassf2Q8BMS9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Rassf2Q8BMS9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Rassf2Q8BMS9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Rassf2Q8BMS9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Rassf2Q8BMS9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Rassf2Q8BMS9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
Rassf2Q8BMS9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29,3 ms