RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HalP35492 657 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gdf7P43029 461 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arpp19P56212 112 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif3eP60229 445 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MylpfP97457 169 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gata5P97489 404 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 OcrlQ6NVF0 900 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrfn2Q80TG9 788 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kctd12bQ8C7J6 292 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zmiz2Q8CIE2 920 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8R1Y2 203 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbc1d19Q8VDV7 526 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TfQ921I1 697 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NamptQ99KQ4 491 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Txndc12Q9CQU0 170 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Noxred1Q9D3S5 366 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scamp5Q9JKD3 235 aa13□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r19G5E8G4 854 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpinb9O08797 374 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PdgfaP20033 211 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stmn2P55821 179 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 S100a5P63084 93 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RalgdsQ03385 852 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 InhbaQ04998 424 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Usp17laQ61068 526 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hsph1Q61699 858 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptk6Q64434 451 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cfap97Q6ZPR1 541 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf365Q8BG89 408 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem74Q8BQU7 305 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcns3Q8BQZ8 491 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tyw3Q8BSA9 257 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhpn2Q8BWR8 686 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SowahcQ8C0J6 512 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slfn5Q8CBA2 884 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp263Q8CF60 680 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim60Q8VI40 466 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sntg2Q925E0 539 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nt5c3aQ9D020 331 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Actrt1Q9D9J3 376 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mkrn2Q9ERV1 416 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fkbp1bQ9Z2I2 108 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfc3h1B2RT41 1992 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Alpk2Q91ZB0 2144 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Col5a3Q9JLI2 1739 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mup13L7N222 235 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Glb1P23780 647 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem26Q3UP23 366 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim24Q64127 1051 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Usp1Q8BJQ2 784 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgef33Q8BW86 850 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap24Q8C4V1 747 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AA792892Q8C6S1 278 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CntrobQ8CB62 887 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Exd1Q8CDF7 570 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Caap1Q8VDY9 356 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wbp11Q923D5 641 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sdcbp2Q99JZ0 292 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Unc45aQ99KD5 944 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tm9sf1Q9DBU0 606 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rassf7Q9DD19 359 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tsc1Q9EP53 1161 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Anxa9Q9JHQ0 345 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc8a3S4R2P9 928 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5538W4VSP6 401 aa12.99□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5485A0A1D5RM98 91 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp8b4A2ANX3 1194 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam71e2L7N480 754 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 UrgcpQ5NCI0 926 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 XiapQ60989 496 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PapolaQ61183 739 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gstt1Q64471 240 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Xpo1Q6P5F9 1071 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atad3Q925I1 591 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mbd1Q9Z2E2 636 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MycsQ9Z304 431 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Numa1E9Q7G0 2094 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Supt3B0QZW4 406 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp94E9Q6Y4 486 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dsg3O35902 993 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppm1aP49443 382 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mc4rP56450 332 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cage1Q5IR70 849 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab34Q64008 259 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bnip1Q6QD59 228 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Coq6Q8R1S0 476 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MceeQ9D1I5 178 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tssk3Q9D2E1 268 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DcpsQ9DAR7 338 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Actl7bQ9QY83 418 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NumbQ9QZS3 653 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r25W4VSP2 855 aa12.98□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm29554A0A087WNW4 188 aa12.97□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4931406B18RikA2RSL7 367 aa12.97□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A930018M24RikB7ZMY3 218 aa12.97□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r103E9PWW0 856 aa12.97□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcng2F7A6P6 480 aa12.97□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spag6Q3V0U9 509 aa12.97□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Inppl1Q6P549 1257 aa12.97□□□□□ -0.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RfflQ6ZQM0 377 aa12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 60.1 ms