Protein–RNA interactions for Protein: Q64008

Rab34, Ras-related protein Rab-34, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab34Q64008 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Rab34Q64008 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rab34Q64008 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rab34Q64008 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rab34Q64008 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rab34Q64008 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rab34Q64008 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Rab34Q64008 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Rab34Q64008 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rab34Q64008 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Rab34Q64008 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rab34Q64008 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rab34Q64008 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
Rab34Q64008 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rab34Q64008 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Rab34Q64008 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rab34Q64008 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rab34Q64008 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rab34Q64008 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Rab34Q64008 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rab34Q64008 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rab34Q64008 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rab34Q64008 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rab34Q64008 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rab34Q64008 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rab34Q64008 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Rab34Q64008 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rab34Q64008 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Rab34Q64008 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rab34Q64008 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rab34Q64008 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Rab34Q64008 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rab34Q64008 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Rab34Q64008 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Rab34Q64008 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Rab34Q64008 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Rab34Q64008 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rab34Q64008 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rab34Q64008 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Rab34Q64008 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rab34Q64008 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rab34Q64008 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Rab34Q64008 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Rab34Q64008 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rab34Q64008 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Rab34Q64008 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rab34Q64008 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rab34Q64008 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rab34Q64008 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rab34Q64008 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rab34Q64008 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rab34Q64008 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rab34Q64008 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rab34Q64008 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rab34Q64008 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Rab34Q64008 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rab34Q64008 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rab34Q64008 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rab34Q64008 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Rab34Q64008 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rab34Q64008 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rab34Q64008 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rab34Q64008 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rab34Q64008 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Rab34Q64008 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rab34Q64008 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rab34Q64008 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rab34Q64008 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rab34Q64008 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Rab34Q64008 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rab34Q64008 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rab34Q64008 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rab34Q64008 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Rab34Q64008 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rab34Q64008 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rab34Q64008 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rab34Q64008 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rab34Q64008 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rab34Q64008 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rab34Q64008 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rab34Q64008 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rab34Q64008 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rab34Q64008 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rab34Q64008 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rab34Q64008 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rab34Q64008 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rab34Q64008 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rab34Q64008 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rab34Q64008 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rab34Q64008 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rab34Q64008 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rab34Q64008 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rab34Q64008 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rab34Q64008 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rab34Q64008 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rab34Q64008 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rab34Q64008 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rab34Q64008 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rab34Q64008 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rab34Q64008 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.9 ms