Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY83

Actl7b, Actin-like protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actl7bQ9QY83 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Actl7bQ9QY83 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Actl7bQ9QY83 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Actl7bQ9QY83 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Actl7bQ9QY83 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Actl7bQ9QY83 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Actl7bQ9QY83 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Actl7bQ9QY83 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Actl7bQ9QY83 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Actl7bQ9QY83 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Actl7bQ9QY83 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Actl7bQ9QY83 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Actl7bQ9QY83 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Actl7bQ9QY83 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Actl7bQ9QY83 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Actl7bQ9QY83 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Actl7bQ9QY83 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Actl7bQ9QY83 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Actl7bQ9QY83 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Actl7bQ9QY83 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Actl7bQ9QY83 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Actl7bQ9QY83 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Actl7bQ9QY83 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Actl7bQ9QY83 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Actl7bQ9QY83 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Actl7bQ9QY83 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Actl7bQ9QY83 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Actl7bQ9QY83 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Actl7bQ9QY83 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Actl7bQ9QY83 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Actl7bQ9QY83 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Actl7bQ9QY83 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Actl7bQ9QY83 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Actl7bQ9QY83 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Actl7bQ9QY83 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Actl7bQ9QY83 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Actl7bQ9QY83 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Actl7bQ9QY83 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Actl7bQ9QY83 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Actl7bQ9QY83 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Actl7bQ9QY83 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Actl7bQ9QY83 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Actl7bQ9QY83 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Actl7bQ9QY83 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Actl7bQ9QY83 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Actl7bQ9QY83 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Actl7bQ9QY83 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Actl7bQ9QY83 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Actl7bQ9QY83 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Actl7bQ9QY83 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Actl7bQ9QY83 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Actl7bQ9QY83 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Actl7bQ9QY83 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Actl7bQ9QY83 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Actl7bQ9QY83 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Actl7bQ9QY83 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Actl7bQ9QY83 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Actl7bQ9QY83 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Actl7bQ9QY83 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Actl7bQ9QY83 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Actl7bQ9QY83 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Actl7bQ9QY83 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Actl7bQ9QY83 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Actl7bQ9QY83 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Actl7bQ9QY83 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Actl7bQ9QY83 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Actl7bQ9QY83 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Actl7bQ9QY83 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Actl7bQ9QY83 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Actl7bQ9QY83 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Actl7bQ9QY83 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Actl7bQ9QY83 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Actl7bQ9QY83 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Actl7bQ9QY83 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Actl7bQ9QY83 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Actl7bQ9QY83 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Actl7bQ9QY83 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Actl7bQ9QY83 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Actl7bQ9QY83 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Actl7bQ9QY83 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Actl7bQ9QY83 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Actl7bQ9QY83 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Actl7bQ9QY83 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Actl7bQ9QY83 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Actl7bQ9QY83 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Actl7bQ9QY83 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Actl7bQ9QY83 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Actl7bQ9QY83 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Actl7bQ9QY83 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Actl7bQ9QY83 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Actl7bQ9QY83 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Actl7bQ9QY83 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Actl7bQ9QY83 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Actl7bQ9QY83 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Actl7bQ9QY83 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Actl7bQ9QY83 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Actl7bQ9QY83 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Actl7bQ9QY83 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Actl7bQ9QY83 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Actl7bQ9QY83 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms