Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
Sdcbp2Q99JZ0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Sdcbp2Q99JZ0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Sdcbp2Q99JZ0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Sdcbp2Q99JZ0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Sdcbp2Q99JZ0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
Sdcbp2Q99JZ0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Sdcbp2Q99JZ0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Sdcbp2Q99JZ0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Sdcbp2Q99JZ0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Sdcbp2Q99JZ0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Sdcbp2Q99JZ0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Sdcbp2Q99JZ0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Sdcbp2Q99JZ0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Sdcbp2Q99JZ0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Sdcbp2Q99JZ0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Sdcbp2Q99JZ0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Sdcbp2Q99JZ0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Sdcbp2Q99JZ0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sdcbp2Q99JZ0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Sdcbp2Q99JZ0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Sdcbp2Q99JZ0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Sdcbp2Q99JZ0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Sdcbp2Q99JZ0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Sdcbp2Q99JZ0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Sdcbp2Q99JZ0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Sdcbp2Q99JZ0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Sdcbp2Q99JZ0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Sdcbp2Q99JZ0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Sdcbp2Q99JZ0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Sdcbp2Q99JZ0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Sdcbp2Q99JZ0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Sdcbp2Q99JZ0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Sdcbp2Q99JZ0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Sdcbp2Q99JZ0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Sdcbp2Q99JZ0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Sdcbp2Q99JZ0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sdcbp2Q99JZ0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Sdcbp2Q99JZ0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Sdcbp2Q99JZ0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Sdcbp2Q99JZ0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Sdcbp2Q99JZ0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Sdcbp2Q99JZ0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Sdcbp2Q99JZ0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sdcbp2Q99JZ0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Sdcbp2Q99JZ0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sdcbp2Q99JZ0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Sdcbp2Q99JZ0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Sdcbp2Q99JZ0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sdcbp2Q99JZ0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sdcbp2Q99JZ0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Sdcbp2Q99JZ0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Sdcbp2Q99JZ0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Sdcbp2Q99JZ0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sdcbp2Q99JZ0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sdcbp2Q99JZ0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sdcbp2Q99JZ0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Sdcbp2Q99JZ0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Sdcbp2Q99JZ0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Sdcbp2Q99JZ0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Sdcbp2Q99JZ0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Sdcbp2Q99JZ0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Sdcbp2Q99JZ0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Sdcbp2Q99JZ0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Sdcbp2Q99JZ0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sdcbp2Q99JZ0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sdcbp2Q99JZ0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Sdcbp2Q99JZ0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Sdcbp2Q99JZ0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Sdcbp2Q99JZ0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sdcbp2Q99JZ0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sdcbp2Q99JZ0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sdcbp2Q99JZ0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sdcbp2Q99JZ0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sdcbp2Q99JZ0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sdcbp2Q99JZ0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sdcbp2Q99JZ0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Sdcbp2Q99JZ0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sdcbp2Q99JZ0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sdcbp2Q99JZ0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Sdcbp2Q99JZ0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Sdcbp2Q99JZ0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sdcbp2Q99JZ0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Sdcbp2Q99JZ0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Sdcbp2Q99JZ0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sdcbp2Q99JZ0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sdcbp2Q99JZ0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sdcbp2Q99JZ0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sdcbp2Q99JZ0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sdcbp2Q99JZ0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sdcbp2Q99JZ0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Sdcbp2Q99JZ0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sdcbp2Q99JZ0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sdcbp2Q99JZ0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sdcbp2Q99JZ0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sdcbp2Q99JZ0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sdcbp2Q99JZ0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms