Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Vmn2r25W4VSP2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Vmn2r25W4VSP2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Vmn2r25W4VSP2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Vmn2r25W4VSP2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Vmn2r25W4VSP2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Vmn2r25W4VSP2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Vmn2r25W4VSP2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Vmn2r25W4VSP2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Vmn2r25W4VSP2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Vmn2r25W4VSP2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Vmn2r25W4VSP2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Vmn2r25W4VSP2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Vmn2r25W4VSP2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Vmn2r25W4VSP2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Vmn2r25W4VSP2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Vmn2r25W4VSP2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Vmn2r25W4VSP2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Vmn2r25W4VSP2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Vmn2r25W4VSP2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Vmn2r25W4VSP2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Vmn2r25W4VSP2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Vmn2r25W4VSP2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Vmn2r25W4VSP2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Vmn2r25W4VSP2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Vmn2r25W4VSP2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Vmn2r25W4VSP2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Vmn2r25W4VSP2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Vmn2r25W4VSP2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Vmn2r25W4VSP2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Vmn2r25W4VSP2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Vmn2r25W4VSP2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Vmn2r25W4VSP2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Vmn2r25W4VSP2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Vmn2r25W4VSP2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Vmn2r25W4VSP2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Vmn2r25W4VSP2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Vmn2r25W4VSP2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Vmn2r25W4VSP2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Vmn2r25W4VSP2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Vmn2r25W4VSP2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Vmn2r25W4VSP2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Vmn2r25W4VSP2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Vmn2r25W4VSP2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Vmn2r25W4VSP2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Vmn2r25W4VSP2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Vmn2r25W4VSP2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vmn2r25W4VSP2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Vmn2r25W4VSP2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Vmn2r25W4VSP2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Vmn2r25W4VSP2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Vmn2r25W4VSP2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Vmn2r25W4VSP2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Vmn2r25W4VSP2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Vmn2r25W4VSP2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Vmn2r25W4VSP2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Vmn2r25W4VSP2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Vmn2r25W4VSP2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Vmn2r25W4VSP2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vmn2r25W4VSP2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Vmn2r25W4VSP2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Vmn2r25W4VSP2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Vmn2r25W4VSP2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Vmn2r25W4VSP2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vmn2r25W4VSP2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vmn2r25W4VSP2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vmn2r25W4VSP2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vmn2r25W4VSP2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vmn2r25W4VSP2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Vmn2r25W4VSP2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vmn2r25W4VSP2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vmn2r25W4VSP2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vmn2r25W4VSP2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Vmn2r25W4VSP2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vmn2r25W4VSP2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vmn2r25W4VSP2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vmn2r25W4VSP2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vmn2r25W4VSP2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Vmn2r25W4VSP2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vmn2r25W4VSP2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vmn2r25W4VSP2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Vmn2r25W4VSP2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vmn2r25W4VSP2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vmn2r25W4VSP2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vmn2r25W4VSP2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vmn2r25W4VSP2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Vmn2r25W4VSP2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vmn2r25W4VSP2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vmn2r25W4VSP2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vmn2r25W4VSP2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vmn2r25W4VSP2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vmn2r25W4VSP2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vmn2r25W4VSP2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vmn2r25W4VSP2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vmn2r25W4VSP2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vmn2r25W4VSP2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vmn2r25W4VSP2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Vmn2r25W4VSP2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vmn2r25W4VSP2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms