RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447232.6

PMS1-215, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 2,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-215ENST00000447232 TAF12Q16514 161 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 ISXQ2M1V0 245 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 MGAT5BQ3V5L5 792 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 C3orf38Q5JPI3 329 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 C10orf76Q5T2E6 689 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 NXPE4Q6UWF7 544 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 C4orf19Q8IY42 314 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 CHPFQ8IZ52 775 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 OR10T2Q8NGX3 314 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 ERLEC1Q96DZ1 483 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 ADPGKQ9BRR6 497 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 DUSP23Q9BVJ7 150 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 CITO14578 2027 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 CKAP5Q14008 2032 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 C2orf78A6NCI8 922 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 LEFTY2O00292 366 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 ACKR2O00590 384 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 TSPAN3O60637 253 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 TULP3O75386 442 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 NOL4O94818 638 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 KRT7P08729 469 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 WT1P19544 449 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 RXRAP19793 462 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 TYMPP19971 482 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 GNLYP22749 145 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 CD27P26842 260 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 ARNTP27540 789 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 RXRGP48443 463 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 TRDNQ13061 729 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 PLCL1Q15111 1095 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 FUT11Q495W5 492 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 OVOS1Q6IE37 1185 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 POU5F2Q8N7G0 328 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 ETNPPLQ8TBG4 499 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 SNX19Q92543 992 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 HPS3Q969F9 1004 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 BIRC7Q96CA5 298 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 GRAMD1AQ96CP6 724 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 MISP3Q96FF7 219 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 CCDC136Q96JN2 1154 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 CCDC113Q9H0I3 377 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 TMEM245Q9H330 911 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 TRPC7Q9HCX4 862 aa3.5□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 TRIM24O15164 1050 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 ANP32CO43423 234 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 WNT1P04628 370 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 P4HBP07237 508 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 CSH1P0DML2 217 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 CSH2P0DML3 217 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 CD8BP10966 210 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 SDSP20132 328 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 POLE2P56282 527 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 RACK1P63244 317 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 CYP4F2P78329 520 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 PDE4CQ08493 712 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 ENPP2Q13822 863 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 TGIF1Q15583 401 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 Q4G0T1 1027 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 SLC39A12Q504Y0 691 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 XKR9Q5GH70 373 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 LY6G5CQ5SRR4 150 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 SDE2Q6IQ49 451 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 USP37Q86T82 979 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 SULF2Q8IWU5 870 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 ARL14Q8N4G2 192 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 STKLD1Q8NE28 680 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 SPPL2BQ8TCT7 592 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 ISL2Q96A47 359 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 MTA3Q9BTC8 594 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 ZMYND12Q9H0C1 365 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 DEC1Q9P2X7 70 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 VAV3Q9UKW4 847 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 TAF6LQ9Y6J9 622 aa3.49□□□□□ -1.85
PMS1-215ENST00000447232 UBE4BO95155 1302 aa3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms