RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420515.1

FAAP20-207, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 1,544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-207ENST00000420515 PRPSAP2O60256 369 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 MOCS3O95396 460 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 ADH1CP00326 375 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 PENKP01210 267 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 TYRP14679 529 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 MAN1A1P33908 653 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 ARL13BQ3SXY8 428 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 DDI1Q8WTU0 396 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 F5H5T6 163 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 DCXO43602 365 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 CD72P21854 359 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 CTHP32929 405 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 OPRD1P41143 372 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 SSR1P43307 286 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 SLC6A11P48066 632 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 WFDC5Q8TCV5 224 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 TMEM51Q9NW97 253 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 AP4E1Q9UPM8 1137 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 NEU3Q9UQ49 428 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 TECTAO75443 2155 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 E9PAM4 449 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 TBL1XO60907 577 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 COMTP21964 271 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 GJC1P36383 396 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 GAD2Q05329 585 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 ERMARDQ5T6L9 678 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 TPRG1Q6ZUI0 275 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 C1orf74Q96LT6 269 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 OSBPL2Q9H1P3 480 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 LZTFL1Q9NQ48 299 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 ARHGEF3Q9NR81 526 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 STIM2Q9P246 746 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 WNT16Q9UBV4 365 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 OR12D3Q9UGF7 316 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 FBXL21Q9UKT6 434 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP28.03■■■□□ 2.089e-11■□□□□ 10.8
FAAP20-207ENST00000420515 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 GRID2IPA4D2P6 1211 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 SRGAP2O75044 1071 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 RARAP10276 462 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 MPPE1Q53F39 396 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 EFHC2Q5JST6 749 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 MANEALQ5VSG8 457 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 SIX5Q8N196 739 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 KLHL11Q9NVR0 708 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 GUCA1BQ9UMX6 200 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 ALG6Q9Y672 507 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 CNTN5O94779 1100 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 NR1H3Q13133 447 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 SEMA3BQ13214 749 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 ALFQ53S48 1182 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 HSPH1Q92598 858 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 EDAQ92838 391 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 MPP6Q9NZW5 540 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-207ENST00000420515 F5P12259 2224 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 CACNG3O60359 315 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 LRIG2O94898 1065 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 AIF1P55008 147 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 MTA1Q13330 715 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 C5orf22Q49AR2 442 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 RNF43Q68DV7 783 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 C11orf63Q6NUN7 778 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 DAAM2Q86T65 1068 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 SFTPA1Q8IWL2 248 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 TXLNBQ8N3L3 684 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 LRRC57Q8N9N7 239 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 LCMT1Q9UIC8 334 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 CYBBP04839 570 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 NCAPGQ9BPX3 1015 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 TSGA10Q9BZW7 698 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP28■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 ATG2BQ96BY7 2078 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 ANTXRLA6NF34 631 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 CREB3O43889 395 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 TULP3O75386 442 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 TNNT1P13805 278 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 KDSRQ06136 332 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 SIGLEC14Q08ET2 396 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 PON2Q15165 354 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 ZNF662Q6ZS27 426 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-207ENST00000420515 REXO1L1PQ8IX06 675 aa27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms