RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 UBE2QL1A1L167 161 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 PITPNAQ00169 270 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 TRAF3Q13114 568 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 CDH18Q13634 790 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 EMC10Q5UCC4 262 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
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