RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293362.7

PSME3-201, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PSME3, Length 3,144 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-201ENST00000293362 TADA2BQ86TJ2 420 aa10.47□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 RELL1Q8IUW5 271 aa10.47□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 URGCPQ8TCY9 931 aa10.47□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 GIPC2Q8TF65 315 aa10.47□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 CABS1Q96KC9 395 aa10.47□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP10.47□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP10.47□□□□□ -0.738e-6■□□□□ 10.8
PSME3-201ENST00000293362 PLAC1Q9HBJ0 212 aa10.47□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 CYLDQ9NQC7 956 aa10.47□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 SMYD2Q9NRG4 433 aa10.47□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 EURLQ9NYK6 297 aa10.47□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa10.47□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 TBKBP1A7MCY6 615 aa10.46□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 MYO1CO00159 1063 aa10.46□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 FBXO21O94952 628 aa10.46□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 SELPP16109 830 aa10.46□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 FOXN2P32314 431 aa10.46□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 ABCG1P45844 678 aa10.46□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 NKX3-2P78367 333 aa10.46□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 WASHC5Q12768 1159 aa10.46□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 DNAJC3Q13217 504 aa10.46□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 MGAT5BQ3V5L5 792 aa10.46□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 ZNF534Q76KX8 674 aa10.46□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 SCD5Q86SK9 330 aa10.46□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa10.46□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 SMC6Q96SB8 1091 aa10.46□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 PKMYT1Q99640 499 aa10.46□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 LRFN2Q9ULH4 789 aa10.46□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 IKBKGQ9Y6K9 419 aa10.46□□□□□ -0.73
PSME3-201ENST00000293362 THSD7BQ9C0I4 1608 aa10.46□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 GOLGA8TH3BQL2 631 aa10.46□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 DGKIO75912 1065 aa10.46□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 CPP00450 1065 aa10.46□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 MGAT1P26572 445 aa10.46□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 PHBP35232 272 aa10.46□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 IRX4P78413 519 aa10.46□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 DPYSQ14117 519 aa10.46□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 FAM26DQ5JW98 314 aa10.46□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa10.46□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 OLFM3Q96PB7 478 aa10.46□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 FOXP3Q9BZS1 431 aa10.46□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa10.46□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 E7ESA3 106 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 DCLK1O15075 740 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 CHADO15335 359 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 JCHAINP01591 159 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 ABHD2P08910 425 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 SCNN1AP37088 669 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 EFEMP1Q12805 493 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 ZBTB17Q13105 803 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 ARL13BQ3SXY8 428 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 RTP2Q5QGT7 225 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 UNC5AQ6ZN44 842 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 ARCQ7LC44 396 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 OTOP3Q7RTS5 596 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 C14orf80Q86SX3 495 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 SPNS2Q8IVW8 549 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 PXYLP1Q8TE99 480 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 SERAC1Q96JX3 654 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 SLC13A1Q9BZW2 595 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 ACSS3Q9H6R3 686 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 SLC17A7Q9P2U7 560 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 A0A0A0MRY4 1105 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 FAM47DPA6NHR8 397 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 PAGE1O75459 146 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 CYP11A1P05108 521 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 INHBAP08476 426 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 ATP5DP30049 168 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 NR2C2P49116 596 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 SLC11A1P49279 550 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 PGGT1BP53609 377 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 DSC1Q08554 894 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 DUSP4Q13115 394 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 MROH9Q5TGP6 573 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP10.45□□□□□ -0.744e-7■■■■■ 30.3
PSME3-201ENST00000293362 CROCCP2Q86T23 111 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 OR52K1Q8NGK4 314 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 SPATA13Q96N96 652 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 ATXN3LQ9H3M9 355 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 GMIPQ9P107 970 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 LGALS13Q9UHV8 139 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 XIRP2A4UGR9 3374 aa10.45□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 ADAM12O43184 909 aa10.44□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 ATP9BO43861 1147 aa10.44□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 GCATO75600 419 aa10.44□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 TCEA3O75764 348 aa10.44□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 PYGBP11216 843 aa10.44□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 ADRA1DP25100 572 aa10.44□□□□□ -0.74
PSME3-201ENST00000293362 BNIPLQ7Z465 357 aa10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms