RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053785.9

Trpc1-201, Transcript of Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trpc1, Length 2,912 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Btbd35f30J3QML3 498 aa20.46■□□□□ 0.87
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Tnfrsf18O35714 228 aa20.46■□□□□ 0.87
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Sox10Q04888 466 aa20.46■□□□□ 0.87
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Kctd21Q3URF8 260 aa20.46■□□□□ 0.87
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Trim17Q7TPM3 477 aa20.46■□□□□ 0.87
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Pomgnt1Q91X88 660 aa20.46■□□□□ 0.87
Trpc1-201ENSMUST00000053785 NamptQ99KQ4 491 aa20.46■□□□□ 0.87
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Wdr89Q9D0R9 386 aa20.46■□□□□ 0.87
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Caln1Q9JJG7 219 aa20.46■□□□□ 0.87
Trpc1-201ENSMUST00000053785 BC035947B2RQY6 695 aa20.46■□□□□ 0.87
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Ism2D3Z6A3 493 aa20.46■□□□□ 0.87
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Gm3739L7N296 216 aa20.46■□□□□ 0.87
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Gm3187M0QWW3 260 aa20.46■□□□□ 0.87
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Cyp2j11Q3UNV2 504 aa20.46■□□□□ 0.87
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Nt5c2Q3V1L4 560 aa20.46■□□□□ 0.87
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Q5EBG8 199 aa20.46■□□□□ 0.87
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Dsg1aQ61495 1057 aa20.46■□□□□ 0.87
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Tmem39bQ810L4 492 aa20.46■□□□□ 0.87
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Hid1Q8R1F6 788 aa20.46■□□□□ 0.87
Trpc1-201ENSMUST00000053785 SelenomQ8VHC3 145 aa20.46■□□□□ 0.87
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Slc25a11Q9CR62 314 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Ap4s1Q9WVL1 144 aa20.46■□□□□ 0.87
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Arhgef10Q8C033 1345 aa20.46■□□□□ 0.87
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Oog1E9Q5G7 496 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Pde9aO70628 534 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Phka1P18826 1241 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Oog4Q4G0C7 502 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 NynrinQ5DTZ0 1840 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Psme4Q5SSW2 1843 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Il15raQ60819 263 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Pim2Q62070 370 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Chst10Q6PGK7 356 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Btnl1Q7TST0 509 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Gpc5Q8CAL5 572 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Q8CD60 292 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Tomm70Q9CZW5 611 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Tmem79Q9D709 391 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Echdc3Q9D7J9 300 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Ifi30Q9ESY9 248 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Mettl1Q9Z120 268 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Gm13040A2A8C4 496 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Gm13101A2ASJ0 481 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Ssxb9A2BI93 185 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Gm13119B1ARV5 481 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Grip2G3XA20 1042 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Gm1587Q3UT80 123 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Krt73Q6NXH9 539 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Jade1Q6ZPI0 834 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Txnrd2Q9JLT4 524 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Nr1h3Q9Z0Y9 445 aa20.45■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Gm45233A0A0N4SVE0 221 aa20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Txnl4aP83877 142 aa20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Lrch2Q3UMG5 773 aa20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Taf5Q8C092 801 aa20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Rab36Q8CAM5 267 aa20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Kat14Q8CID0 779 aa20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Trib2Q8K4K3 343 aa20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Olfr807Q8VGI9 311 aa20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 CmasQ99KK2 432 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Gid8Q9D7M1 228 aa20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 EtfbQ9DCW4 255 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Tuba8Q9JJZ2 449 aa20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Tjp3Q9QXY1 905 aa20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Gyg1Q9R062 333 aa20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Apol11aE9PZG0 334 aa20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Samd11Q1RNF8 542 aa20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Srrm1Q52KI8 946 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Satb1Q60611 764 aa20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Mark4Q8CIP4 752 aa20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Slc22a7Q91WU2 540 aa20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 DpysQ9EQF5 519 aa20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Cables1Q9ESJ1 568 aa20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Tgm1Q9JLF6 815 aa20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Sucla2Q9Z2I9 463 aa20.44■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Ankrd34aB2RW11 495 aa20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Sult3a1O35403 293 aa20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Prl3b1P09586 222 aa20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 DckP43346 260 aa20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 AdprhP54923 362 aa20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 4933427I04RikQ3V053 235 aa20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Acvrl1Q61288 502 aa20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Slain1Q68FF7 579 aa20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Mrps35Q8BJZ4 320 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Lurap1lQ8K2P1 221 aa20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Akap17bA2A3V1 959 aa20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Prdm12A2AJ77 365 aa20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Tex28B1AYN9 409 aa20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Slc1a6O35544 561 aa20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Sptlc1O35704 473 aa20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Ap3d1O54774 1199 aa20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Axin2O88566 840 aa20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Hcn2O88703 863 aa20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Hoxc11P31313 304 aa20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Gabrb3P63080 473 aa20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Parp3Q3ULW8 533 aa20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Syn2Q64332 586 aa20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Homer3Q99JP6 356 aa20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Prpf19Q99KP6 504 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 AadacQ99PG0 398 aa20.43■□□□□ 0.86
Trpc1-201ENSMUST00000053785 Kat2bQ9JHD1 813 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 4504 ms