RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641340.1

MFSD8-223, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 2,098 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-223	ENST00000641340	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PEX5	P50542	639 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	SLC16A1	P53985	500 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	HDAC4	P56524	1084 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ACTR2	P61160	394 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	HAND2	P61296	217 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	TFAP4	Q01664	338 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	KRT17	Q04695	432 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PRKCZ	Q05513	592 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	NFIA	Q12857	509 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PAK1	Q13153	545 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	TRADD	Q15628	312 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	GPR68	Q15743	365 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	XKR9	Q5GH70	373 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	BNIPL	Q7Z465	357 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	RAB7B	Q96AH8	199 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	RGMA	Q96B86	450 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	RMDN1	Q96DB5	314 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	IQCD	Q96DY2	449 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CMTM3	Q96MX0	182 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	GDF15	Q99988	308 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	MALT1	Q9UDY8	824 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	STK39	Q9UEW8	545 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	SBF1	O95248	1867 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CCDC151	A5D8V7	595 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	FCHO1	O14526	889 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	TLR2	O60603	784 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	DAB1	O75553	588 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ACTN1	P12814	892 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ADSS	P30520	456 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CTBS	Q01459	385 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	TNP2	Q05952	138 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ITIH3	Q06033	890 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	RCN2	Q14257	317 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CDH24	Q86UP0	819 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	KRT222	Q8N1A0	295 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	TTLL6	Q8N841	843 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	KIF18A	Q8NI77	898 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PTPN18	Q99952	460 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	REEP2	Q9BRK0	252 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ERP44	Q9BS26	406 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ISM1	B1AKI9	464 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	BIN1	O00499	593 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ALDH1A2	O94788	518 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	ITGA2B	P08514	1039 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	PTPRA	P18433	802 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	JAK1	P23458	1154 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	OR1G1	P47890	313 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	GMFB	P60983	142 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	RIPK1	Q13546	671 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	IL10RA	Q13651	578 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MFSD8-223	ENST00000641340	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms