RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 NFRKBQ6P4R8 1299 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 STOX1Q6ZVD7 989 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF280BQ86YH2 543 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEFF1Q8IYR6 380 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NCOA7Q8NI08 942 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 GOLGA1Q92805 767 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 AJUBAQ96IF1 538 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 PWWP2AQ96N64 755 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 GPHA2Q96T91 129 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 IMPG2Q9BZV3 1241 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SIK2Q9H0K1 926 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TSPY26PQ9H489 355 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM83DQ9H4H8 585 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 PRDM13Q9H4Q3 707 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NOD2Q9HC29 1040 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SIRT5Q9NXA8 310 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 DERAQ9Y315 318 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CDY1Q9Y6F8 540 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TAF1P21675 1872 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 DLEC1Q9Y238 1755 aa4.57□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 BCL9LQ86UU0 1499 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PRQ8 180 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 J3KTA2 159 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF213O14771 459 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 DCLK1O15075 740 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SPTLC2O15270 562 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 DHHO43323 396 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAM23O75077 832 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP6R2O75170 966 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 VPS4BO75351 444 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 IDH1O75874 414 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM63AO94886 807 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CSF1P09603 554 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 AKT1P31749 480 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 MCM5P33992 734 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 LIMS1P48059 325 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 GP2P55259 537 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TRDNQ13061 729 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ERV3-1Q14264 604 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 IQCB1Q15051 598 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNMB1Q16558 191 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SPECC1Q5M775 1068 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 USP30Q70CQ3 517 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 REXO1L1PQ8IX06 675 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SYNE4Q8N205 404 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXL16Q8N461 479 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 PDPRQ8NCN5 879 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 OR14K1Q8NGZ2 314 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TBC1D15Q8TC07 691 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF125Q96EQ8 232 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC46A1Q96NT5 459 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 MOGAT1Q96PD6 335 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SGPP1Q9BX95 441 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC2Q9BYS8 371 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NYXQ9GZU5 481 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 BRD8Q9H0E9 1235 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC25A32Q9H2D1 315 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 GHITMQ9H3K2 345 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ACAD9Q9H845 621 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 FSCN3Q9NQT6 498 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TMOD4Q9NZQ9 345 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 KCND3Q9UK17 655 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TBX20Q9UMR3 447 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 DUOX1Q9NRD9 1551 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 MYH2Q9UKX2 1941 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CACNA1SQ13698 1873 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 UBR3Q6ZT12 1888 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CARMIL3Q8ND23 1372 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF532Q9HCE3 1301 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SALL1Q9NSC2 1324 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TBKBP1A7MCY6 615 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 JAK2O60674 1132 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 PIAS2O75928 621 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 VIPP01282 170 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 GNAT2P19087 354 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC6A2P23975 617 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CSF2RBP32927 897 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 GALNSP34059 522 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 STAT1P42224 750 aa4.55□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NPTX2P47972 431 aa4.55□□□□□ -1.68
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