RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538266.5

SNHG1-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 3 BASIC

Gene SNHG1, Length 347 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-208	ENST00000538266	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PRO3102	Q9H379	93 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	DMAC2	Q9NW81	257 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	DPP3	Q9NY33	737 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	SPG21	Q9NZD8	308 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67	2e-26	■□□□□ 8.9
SNHG1-208	ENST00000538266	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67	2e-7	■■■■■ 35.3
SNHG1-208	ENST00000538266	GBF1	Q92538	1859 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CEP290	O15078	2479 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	WNT9A	O14904	365 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	IKBKB	O14920	756 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TRAPPC3	O43617	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TADA2A	O75478	443 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	RFPL3	O75679	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	FGF18	O76093	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	DDHD2	O94830	711 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ASGR2	P07307	311 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	C8A	P07357	584 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PYGM	P11217	842 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PFKL	P17858	780 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PML	P29590	882 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CA8	P35219	290 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	BMPR1A	P36894	532 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PBX3	P40426	434 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PNPLA4	P41247	253 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	RAP1GAP	P47736	663 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	GCLM	P48507	274 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	SLC11A1	P49279	550 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	MXI1	P50539	228 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	EPHB3	P54753	998 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	RBP5	P82980	135 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TAP1	Q03518	808 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ENPEP	Q07075	957 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CRY1	Q16526	586 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	EPC2	Q52LR7	807 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	XKR4	Q5GH76	650 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ANKRD7	Q92527	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	THAP9	Q9H5L6	903 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	INTS13	Q9NVM9	706 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	MYOT	Q9UBF9	498 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	STK39	Q9UEW8	545 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	DSE	Q9UL01	958 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	ANK1	P16157	1881 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG1-208	ENST00000538266	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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