RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524356.1

PCM1-223, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 2

Gene PCM1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-223	ENST00000524356	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	RADIL	Q96JH8	1075 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	EBF3	Q9H4W6	596 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	PRSS50	Q9UI38	385 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	FEM1B	Q9UK73	627 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	KIF1A	Q12756	1690 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ADCY9	O60503	1353 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	CPD	O75976	1380 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ATP7B	P35670	1465 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	LINC00473	A8K010	186 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	JUP	P14923	745 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	NPR1	P16066	1061 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SLC7A1	P30825	629 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	CCR5	P51681	352 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	LGALS4	P56470	323 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	KRTAP10-5	P60370	271 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	TLE2	Q04725	743 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	NOG	Q13253	232 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	FGL2	Q14314	439 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	HSCB	Q8IWL3	235 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF480	Q8WV37	535 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	DPF2	Q92785	391 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	DLC1	Q96QB1	1528 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	PPL	O60437	1756 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SBF2	Q86WG5	1849 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	BCL9	O00512	1426 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	CRB1	P82279	1406 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356		A0A1W2PPL8	197 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	C19orf81	C9J6K1	198 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	PROM1	O43490	865 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	IGHD	P01880	384 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	A1BG	P04217	495 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SCP2	P22307	547 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	PTPN7	P35236	360 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ACTN2	P35609	894 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	WAS	P42768	502 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	LINC00205	P59089	165 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	PLIN5	Q00G26	463 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	PPP2R5C	Q13362	524 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	TRPC3	Q13507	836 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	PLS1	Q14651	629 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	PSMD6	Q15008	389 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	HECTD3	Q5T447	861 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	CFAP58	Q5T655	872 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	TEX11	Q8IYF3	940 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PCM1-223	ENST00000524356	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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