RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523936.5

RPS20-210, Transcript of ribosomal protein S20, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RPS20, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS20-210ENST00000523936 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 ARID5AQ03989 594 aa20.1■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 KRT39Q6A163 491 aa20.1■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 FAM124AQ86V42 546 aa20.1■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 ANKRD52Q8NB46 1076 aa20.1■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa20.1■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 SEMA4DQ92854 862 aa20.1■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.1■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 CISHQ9NSE2 258 aa20.1■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 STOML2Q9UJZ1 356 aa20.1■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 ZBED1O96006 694 aa20.09■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 TKTL1P51854 596 aa20.09■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 ZNF445P59923 1031 aa20.09■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 KIF19Q2TAC6 998 aa20.09■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 ARID3AQ99856 593 aa20.09■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 FBRSQ9HAH7 460 aa20.09■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 SCUBE2Q9NQ36 999 aa20.09■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 BTBD3Q9Y2F9 522 aa20.09■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 SNX11Q9Y5W9 270 aa20.09■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 PRR29P0C7W0 189 aa20.08■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 GRIA4P48058 902 aa20.08■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 HARS2P49590 506 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 SLC8A3P57103 927 aa20.08■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 ADAM9Q13443 819 aa20.08■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 TEAD4Q15561 434 aa20.08■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 PTPRNQ16849 979 aa20.08■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 ADIPOR2Q86V24 386 aa20.08■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 FMNL3Q8IVF7 1028 aa20.08■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 GALNT15Q8N3T1 639 aa20.08■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 SNX19Q92543 992 aa20.08■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 ULBP1Q9BZM6 244 aa20.08■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 TM9SF3Q9HD45 589 aa20.08■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 PLA2G4CQ9UP65 541 aa20.08■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa20.08■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 RAXQ9Y2V3 346 aa20.08■□□□□ 0.81
RPS20-210ENST00000523936 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 TULP2O00295 520 aa20.07■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 TSPAN3O60637 253 aa20.07■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 SEMA4FO95754 770 aa20.07■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 LATS1O95835 1130 aa20.07■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 ZBTB16Q05516 673 aa20.07■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 DPYDQ12882 1025 aa20.07■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 CAMK2BQ13554 666 aa20.07■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.07■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 CHST9Q7L1S5 443 aa20.07■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 FBXL13Q8NEE6 735 aa20.07■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.07■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa20.07■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 BIRC7Q96CA5 298 aa20.07■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 BTBD1Q9H0C5 482 aa20.07■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 RAB20Q9NX57 234 aa20.07■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.07■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 TNFSF14O43557 240 aa20.06■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 PCDHGA12O60330 932 aa20.06■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 RPS14P62263 151 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 ADGRF1Q5T601 910 aa20.06■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 AHI1Q8N157 1196 aa20.06■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 ZNF366Q8N895 744 aa20.06■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 IGSF8Q969P0 613 aa20.06■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 TIGD1Q96MW7 591 aa20.06■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 ORAI3Q9BRQ5 295 aa20.06■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 PRSS16Q9NQE7 514 aa20.06■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 ABCB8Q9NUT2 735 aa20.06■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa20.06■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 GGA2Q9UJY4 613 aa20.06■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.84e-7■□□□□ 10.5
RPS20-210ENST00000523936 SHROOM3Q8TF72 1996 aa20.06■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 ASXL3Q9C0F0 2248 aa20.06■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 CD27P26842 260 aa20.05■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 GRK6P43250 576 aa20.05■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 MXI1P50539 228 aa20.05■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 CCT8P50990 548 aa20.05■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 BCAT1P54687 386 aa20.05■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 BSPRYQ5W0U4 402 aa20.05■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 TATDN2Q93075 761 aa20.05■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 SGK2Q9HBY8 427 aa20.05■□□□□ 0.8
RPS20-210ENST00000523936 TSPAN16Q9UKR8 245 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms