RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 GATA6Q92908 595 aa17.63■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 CEP63Q96MT8 703 aa17.63■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 CAMK1GQ96NX5 476 aa17.63■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 NUP58Q9BVL2 599 aa17.63■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 ABCB8Q9NUT2 735 aa17.63■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 MAN1B1Q9UKM7 699 aa17.63■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa17.63■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP17.63■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa17.63■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 FRYQ5TBA9 3013 aa17.63■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 CEP295Q9C0D2 2601 aa17.62■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa17.62■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 METTL12A8MUP2 240 aa17.62■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 M0QYV0 167 aa17.62■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 PMM2O15305 246 aa17.62■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 SH3BP5O60239 455 aa17.62■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 SLC14A1Q13336 389 aa17.62■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
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HERC3-211ENST00000513325 ZNF366Q8N895 744 aa17.62■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa17.62■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 CLEC4CQ8WTT0 213 aa17.62■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 IRGQQ8WZA9 623 aa17.62■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 TMEM245Q9H330 911 aa17.62■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 GGA2Q9UJY4 613 aa17.62■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 KLK13Q9UKR3 277 aa17.62■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 PLA2G4CQ9UP65 541 aa17.62■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa17.62■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 CKAP5Q14008 2032 aa17.62■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 CACNA1EQ15878 2313 aa17.61■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 IGLV3-27P01718 113 aa17.61■□□□□ 0.41
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HERC3-211ENST00000513325 SLC6A4P31645 630 aa17.61■□□□□ 0.41
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HERC3-211ENST00000513325 CETN1Q12798 172 aa17.61■□□□□ 0.41
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HERC3-211ENST00000513325 PIK3R6Q5UE93 754 aa17.61■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 MBLAC2Q68D91 279 aa17.61■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 TTI2Q6NXR4 508 aa17.61■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
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HERC3-211ENST00000513325 AHI1Q8N157 1196 aa17.61■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP17.61■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 WFDC5Q8TCV5 224 aa17.61■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 HSFY1Q96LI6 401 aa17.61■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa17.61■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 MIS12Q9H081 205 aa17.61■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 LHX5Q9H2C1 402 aa17.61■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
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HERC3-211ENST00000513325 CD70P32970 193 aa17.6■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 RDXP35241 583 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R2P41236 205 aa17.6■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 SLC11A2P49281 568 aa17.6■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 TBX4P57082 545 aa17.6■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 STILQ15468 1287 aa17.6■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
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HERC3-211ENST00000513325 ARHGEF19Q8IW93 802 aa17.6■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa17.6■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 NELFBQ8WX92 580 aa17.6■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 GOLGA1Q92805 767 aa17.6■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 MSRB2Q9Y3D2 182 aa17.6■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa17.6■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 TMEM8BA6NDV4 472 aa17.59■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 P4HA2O15460 535 aa17.59■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 ACSL4O60488 711 aa17.59■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
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HERC3-211ENST00000513325 ACSL1P33121 698 aa17.59■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 GCNT1Q02742 428 aa17.59■□□□□ 0.41
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HERC3-211ENST00000513325 BECN1Q14457 450 aa17.59■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 MPP7Q5T2T1 576 aa17.59■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 NADSYN1Q6IA69 706 aa17.59■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 NAXDQ8IW45 347 aa17.59■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 EHBP1Q8NDI1 1231 aa17.59■□□□□ 0.41
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HERC3-211ENST00000513325 SNX19Q92543 992 aa17.59■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 IL21RQ9HBE5 538 aa17.59■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 PRSS16Q9NQE7 514 aa17.59■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 STIM2Q9P246 746 aa17.59■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 CTNND2Q9UQB3 1225 aa17.59■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa17.59■□□□□ 0.41
HERC3-211ENST00000513325 ZFHX4Q86UP3 3567 aa17.59■□□□□ 0.41
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