RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 SYCE2Q6PIF2 218 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 ACTRT2Q8TDY3 377 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 WASF1Q92558 559 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM125Q96AQ2 219 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 TEKT5Q96M29 485 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 TLR10Q9BXR5 811 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 SPATC1LQ9H0A9 340 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 KCTD5Q9NXV2 234 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 BARHL2Q9NY43 387 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 MYADML2A6NDP7 307 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 SGTAO43765 313 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 KATNA1O75449 491 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 MMP1P03956 469 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 SBK3P0C264 359 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 HSPA6P17066 643 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PDCP20941 246 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 FBLP22087 321 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CALML3P27482 149 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CD38P28907 300 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 SLC6A4P31645 630 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 KRT2P35908 639 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 TM4SF4P48230 202 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PTH2RP49190 550 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 SREBF2Q12772 1141 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 NOGQ13253 232 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 NPY5RQ15761 445 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC142Q17RM4 750 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 BLIDQ8IZY5 108 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 IFI44Q8TCB0 444 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 NELL1Q92832 810 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 KAT5Q92993 513 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 ZMYND12Q9H0C1 365 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PORCNQ9H237 461 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PSTPIP2Q9H939 334 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 C6orf50Q9HD87 102 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 RNF146Q9NTX7 359 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CHMP5Q9NZZ3 219 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 COL20A1Q9P218 1284 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHA6Q9UN73 950 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 KIF3AQ9Y496 699 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 ABCB11O95342 1321 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC154A6NI56 674 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 MEIS2O14770 477 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PEX1O43933 1283 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHGA12O60330 932 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PGK2P07205 417 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 XBP1P17861 261 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 EPHB1P54762 984 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CNTN2Q02246 1040 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF844Q08AG5 666 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 RAB39AQ14964 217 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 UAP1L1Q3KQV9 507 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 SLC30A10Q6XR72 485 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CLNKQ7Z7G1 428 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 AOPEPQ8N6M6 819 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC148Q8NFR7 591 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CUL5Q93034 780 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CLPTM1LQ96KA5 538 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 TAAR1Q96RJ0 339 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 HEPHQ9BQS7 1158 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 TEX13BQ9BXU2 312 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PRDM13Q9H4Q3 707 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 RIC8AQ9NPQ8 531 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 SH3GLB2Q9NR46 395 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 RNF186Q9NXI6 227 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 JKAMPQ9P055 326 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 IPPQ9Y573 584 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa5.3□□□□□ -1.56
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