RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 KCNJ5P48544 419 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 DGKEP52429 567 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 UCP3P55916 312 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 HUNKP57058 714 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 E2F1Q01094 437 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
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PTPRC-204ENST00000367379 STK31Q9BXU1 1019 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRC-204ENST00000367379 THP07101 528 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 AKAP5P24588 427 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 SLC11A2P49281 568 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-204ENST00000367379 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 AGBL3Q8NEM8 1001 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 ABHD8Q96I13 439 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 MRGPRX1Q96LB2 322 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-204ENST00000367379 TMX2Q9Y320 296 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-204ENST00000367379 AP4M1O00189 453 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 ADAM10O14672 748 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 VNN1O95497 513 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-204ENST00000367379 PSG6Q00889 435 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 SATB1Q01826 763 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-204ENST00000367379 ALDH2P05091 517 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRC-204ENST00000367379 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
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PTPRC-204ENST00000367379 GHRHRQ02643 423 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 ADAMTS15Q8TE58 950 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 CUL5Q93034 780 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 MYH16Q9H6N6 1097 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 AMFRQ9UKV5 643 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 IL16Q14005 1332 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 RTL9Q8NET4 1388 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 LRRC37AA6NMS7 1700 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRC-204ENST00000367379 A0A087WWL8 130 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRC-204ENST00000367379 NF2P35240 595 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 THBS4P35443 961 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 KCNJ4P48050 445 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 MGAT5BQ3V5L5 792 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 LEXMQ3ZCV2 418 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 DEF8Q6ZN54 512 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 SIRT6Q8N6T7 355 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 SPATA3Q8NHX4 192 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-204ENST00000367379 HPS3Q969F9 1004 aa5.65□□□□□ -1.5
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