RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109698.8

Sh3bp1-204, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 DmgdhQ9DBT9 869 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cyp4a12bA2A974 508 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tbc1d16A2ABG4 766 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Casq2O09161 415 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Il12aP43431 215 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Flt3lgP49772 232 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sycp3P70281 254 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 McuQ3UMR5 350 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Xkr5Q5GH66 676 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 ToporsQ80Z37 1033 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gtf3c4Q8BMQ2 817 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gspt1Q8R050 636 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Igsf8Q8R366 611 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 ClmpQ8R373 373 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zcchc14Q8VIG0 956 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cyp4a12aQ91WL5 508 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 PpanQ91YU8 470 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Lpin1Q91ZP3 924 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Clp1Q99LI9 425 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Acox2Q9QXD1 681 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Padi3Q9Z184 664 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ankfn1A0A140LIW7 1083 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Lcn6A2AJB9 181 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Serpina3iD3Z450 408 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 RxrbP28704 520 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Btbd1P58544 488 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 RnaselQ05921 735 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Grm6Q5NCH9 871 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nuak1Q641K5 658 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Glra2Q7TNC8 452 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Barhl2Q8VIB5 384 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mrpl9Q99N94 265 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fam173bQ9D1Z3 247 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sgf29Q9DA08 293 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 CenpkQ9ESN5 271 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Krt71Q9R0H5 524 aa20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cd247P24161 164 aa20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 PhbP67778 272 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Serac1Q3U213 654 aa20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Arglu1Q3UL36 271 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm29609Q3UU56 907 aa20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Taok1Q5F2E8 1001 aa20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Vwa2Q70UZ7 791 aa20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dnajb13Q80Y75 316 aa20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gtf2a2Q80ZM7 109 aa20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gtf3c2Q8BL74 907 aa20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rd3Q8BRE0 195 aa20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zfp263Q8CF60 680 aa20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Lrp8Q924X6 996 aa20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Oser1Q9D722 291 aa20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ascc1Q9D8Z1 356 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ddx21Q9JIK5 851 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kiaa0100Q5SYL3 2234 aa20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kcng1A2BDX4 514 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Adamts6D3Z1A5 1117 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm5415E9PXF3 478 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tnfrsf11bO08712 401 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gfra2O08842 464 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 MycP01108 439 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Inpp5jP59644 1003 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Vps45P97390 570 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Shroom1Q5SX79 823 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 TwistnbQ78WZ7 330 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ip6k2Q80V72 448 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tmx4Q8C0L0 335 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trmt11Q9CWH5 460 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Arl2Q9D0J4 184 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ccdc103Q9D9P2 237 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 AatfQ9JKX4 526 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Card9A2AIV8 536 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ism1A2ATD1 454 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 SmgcF6VRN1 385 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 FaahO08914 579 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 ShdO88834 343 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P01648 108 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 AfpP02772 605 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tsta3P23591 321 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pecam1Q08481 727 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 PrlrQ08501 608 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Q80WR5 230 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cybrd1Q925G2 290 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ophn1Q99J31 802 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 TarsQ9D0R2 722 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Atad1Q9D5T0 361 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 GgcxQ9QYC7 757 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dnajb2Q9QYI5 324 aa20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 PtprfA2A8L5 1898 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kifc3O35231 824 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P01631 113 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P01878 344 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ces1cP23953 554 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cdo1P60334 200 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fmo3P97501 534 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc24a2Q14BI1 711 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Podnl1Q6P3Y9 559 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr1198Q7TR12 308 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nup54Q8BTS4 510 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Usp27Q8CEG8 438 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc36a1Q8K4D3 475 aa20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fam151aQ8QZW3 608 aa20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.2 ms